其實，各個朝代都有很多皇子夭亡的情況出現。清代時期，其實沒有多少近親通婚的事例。清朝有九大權族，僅“王”系就有63個分支，皇帝要與三等親女性親屬結合的機率實際上是非常小的，所以“近親結婚”說不通。

目前史學界對這種現象，一般總結為三大原因：

1.醫學水平限制

到了今天，很多幼兒疾病已經得到了控制。但是在數百年前的清代，醫學水準尚不發達，相應的藥品也沒有被研發出來。而有些疾病卻是幼兒高發，如百日咳、猩紅熱、水痘、疹，當然也包括過敏等等。

那個時代，就算有了準確的診斷，但沒有抗生素，而且也難以測試人體對藥物的過敏性，即藥物可能對症，但不對人。我們到今天，使用很多藥物還要做過敏測試，清代哪有這樣的條件。

另外，如果是常人家的孩子，醫生藝高膽大，也可以使用“偏方”來進行醫治。但涉及到皇族，即使對症，醫生也不敢輕易用藥，尤其是那些“偏方”。

看過電視劇《大宅門》，裡面有一個情節，沈樹仁給慈禧治病，來向白家求借“八寶”時說，"這個病換個什麼人得，我也敢說三劑湯藥保好，可不行啊，萬一出點兒事兒，我還一大家子人吶！"所以他給慈禧開方子，不過是“平和”“點綴”的藥物罷了。

也正因如此，很多皇子就是活活被耽誤了。

2.文化傾向限制

很多人受電影、電視劇的誤導，以為那些漢族太醫包攬了皇庭的健康問題。但事實上，由於民族分歧，皇族並沒有那樣委以漢官太醫重任，而是能靠滿醫就靠滿醫。

我們都知道，滿族的醫學水平是不如漢族的，他們治來治去治不好，這才交給漢族醫官，因此，也會造成患者病程進一步發展。

在溥儀的《我的前半生》裡就有相關描述，溥儀有一次生病，滿族醫官治不好，直到最後請出了溥儀的老師朱益藩才算治癒，差點耽誤了。

還有同治皇帝時的《萬歲爺天花喜進藥用藥底簿》記載，剛開始都是滿醫治療。

另外，清廷皇族一貫迷信，生病之後最先想到的不是醫生，而是讓和尚、喇嘛來作法驅邪——所以說迷信害人啊。

3.派系內部鬥爭

這跟普通的“宮鬥”又有不同。很多人設想的，妃嬪之間暗鬥其實不存在。畢竟長幼有序，年齒排資，戕害幼年皇子幾乎沒有多大意義，做這種事弊大於利，划不來。

主要是太醫之間的爭鬥，或與官僚派閥有關。

舉個例子，《神醫喜來樂》那樣，明知道喜來樂有治病的本事，但王天和百般阻攔，用意很明顯，我治不好，也不能讓別人治好，不能砸自己的招牌。

這樣一來，皇子們的小命就不太容易保得住了。

也難怪劉子鸞說，“願生不復帝王家”。夠倒黴的。

個人覺得應該多歸結於三方面的因素：首先，不排除近親結婚造成的因素在裡面，世間萬物凡有生命的，都要遵循自然遺傳規律，方能生生不息而茁壯生長。古代皇親國戚崇尚親上加親，不是表哥表妹就是什麼的親戚，甚至亂倫淫穢不堪，生出來的娃兒不是先天畸形就是家族遺傳病頻頻，所以即便活下來，身體底子在那的，當然不會長命。其次，宮廷勾心鬥角，不擇手段謀權上位的比比皆是，一旦聽說競爭對手懷孕了就會擔心日後影響到自己的實力更迭，所以，暗中下藥的，出陰招索人命的，在娃娃還沒出生之前就被偷偷餵了慢性毒藥的肯定是防不勝防，，你說在這樣環境下出生的嬰兒能健康麼？比起現代人，定期產檢，科學的優生優育差別不是點吧點吧的哦！最後還有，隨著現代醫學的進步和發達，大家是有目共睹的，這裡不再囉嗦！