區別：孟德爾認為遺傳因子就像一個個獨立的顆粒,既不會相互融合,也不會在傳遞中消失。融合遺傳認為兩親代在雜種後代中產生新的性狀。子代的性狀是親代性狀的平均結果，且雜合子後代中沒有一定的分離比例。兩種的區別就好像一個紅球和一個藍球放到試管當中，從上面看雖然只能看到一種顏色，但另一種顏色並沒有消失，只是在下面隱藏起來，而紅墨水和藍墨水一起放到試管中，就會融合成新的顏色，是前面兩種顏色平均的結果。補充說明：1、分離定律和自由組合定律，統稱為孟德爾遺傳規律。1）分離定律：（1）F1的全部植株，都只表現某一親本的性狀（顯性性狀），而另一親本的性狀，則被暫時遮蓋而未表現（隱性性狀）。（2）在F2裡，雜交親本的相對性狀——顯性性狀和隱性性狀又都表現出來了，這就是性狀分離現象。由此可見，隱性性狀在F1裡並沒有消失，只是暫時被遮蓋而未能得以表現罷了。（3）在F2的群體中，具有顯性性狀的植株數與具有隱性性狀的植株數，常常表現出一定的分離比，其比值近似於3∶1。2）自由組合定律：孟德爾在揭示了由一對遺傳因子（或一對等位基因）控制的一對相對性狀雜交的遺傳規律——分離規律之後，又接連進行了兩對、三對甚至更多對相對性狀雜交的遺傳試驗，進而又發現了第二條重要的遺傳學規律，即自由組合規律，也有人稱它為獨立分配規律。一個親本——黃色圓形的豌豆是純合子，其基因型為YYRR，在這裡，Y代表黃色，R代表圓形，由於它們都是顯性，故用大寫字母表示。而選用的另一親本——綠色皺形豌豆也是純合子，其基因型為yyrr，這裡y代表綠色，r代表皺形，由於它們都是隱性，所以用小寫字母來表示。由於這兩個親本都是純合體，所以它們都只能產生一種型別的配子，即：YYRR——YRyyrr——yr二者雜交，YR配子與yr配子結合，所得後代F1的基因型全為YyRr，即全為雜合體。由於基因間的顯隱性關係，所以F1的表現型全為黃色圓形種子。雜合的F1在形成配子時，根據分離規律，即Y與y分離，R與r分離，然後每對基因中的一個成員各自進入到下一個配子中，這樣，在分離了的各對基因成員之間，便會出現隨機的自由組合，即：（1） Y與R組合成YR；（2）Y與r組合成Yr；（3）y與R組合成yR；（4）y與r組合成yr。由於它們彼此間相互組合的機會均等，因此雜種F1（YyRr）能夠產生四種不同型別、相等數量的配子。當雜種F1自交時，這四種不同型別的雌雄配子隨機結合，便在F2中產生16種組合中的9種基因型合子。由於顯隱性基因的存在，這9種基因型只能有四種表現型，即：黃色圓形、黃色皺形、綠色圓形、綠色皺形。它們之間的比例為9∶3∶3∶1。這就是自由組合定律。2、融合遺傳是早期的一種遺傳理論，與顆粒遺傳相對。融合遺傳是1868年由達爾文提出的。它主張兩親代的相對性狀在雜種後代中融合而成為新的性狀而出現，也即子代的性狀是親代性狀的平均結果，且雜合子後代中沒有一定的分離比例。融合遺傳方式是雜交後代的性狀介於兩親本之間，若雜交後代自交，性狀不會分離;若測交再次介於兩者的狀態之間。當時的人們普遍相信融合遺傳，認為後代是父母性狀(或者說血緣)融合的結果，比如黑人和白人通婚後生下的小孩膚色介於中間，如果一個白人到黑人部落生活、繁衍，他的後代的膚色會變得越來越黑，白膚色這種性狀最終會消失。同理可證，一個適應環境的優秀變異也會一代一代地被其他變異稀釋掉，而無法得到傳播。達爾文認為就是類似液體的胚芽融合的結果，且以這種方式傳遞的遺傳性狀的後代中不分離，這個理論目前認為是錯誤的。
區別：孟德爾認為遺傳因子就像一個個獨立的顆粒,既不會相互融合,也不會在傳遞中消失。融合遺傳認為兩親代在雜種後代中產生新的性狀。子代的性狀是親代性狀的平均結果，且雜合子後代中沒有一定的分離比例。兩種的區別就好像一個紅球和一個藍球放到試管當中，從上面看雖然只能看到一種顏色，但另一種顏色並沒有消失，只是在下面隱藏起來，而紅墨水和藍墨水一起放到試管中，就會融合成新的顏色，是前面兩種顏色平均的結果。補充說明：1、分離定律和自由組合定律，統稱為孟德爾遺傳規律。1）分離定律：（1）F1的全部植株，都只表現某一親本的性狀（顯性性狀），而另一親本的性狀，則被暫時遮蓋而未表現（隱性性狀）。（2）在F2裡，雜交親本的相對性狀——顯性性狀和隱性性狀又都表現出來了，這就是性狀分離現象。由此可見，隱性性狀在F1裡並沒有消失，只是暫時被遮蓋而未能得以表現罷了。（3）在F2的群體中，具有顯性性狀的植株數與具有隱性性狀的植株數，常常表現出一定的分離比，其比值近似於3∶1。2）自由組合定律：孟德爾在揭示了由一對遺傳因子（或一對等位基因）控制的一對相對性狀雜交的遺傳規律——分離規律之後，又接連進行了兩對、三對甚至更多對相對性狀雜交的遺傳試驗，進而又發現了第二條重要的遺傳學規律，即自由組合規律，也有人稱它為獨立分配規律。一個親本——黃色圓形的豌豆是純合子，其基因型為YYRR，在這裡，Y代表黃色，R代表圓形，由於它們都是顯性，故用大寫字母表示。而選用的另一親本——綠色皺形豌豆也是純合子，其基因型為yyrr，這裡y代表綠色，r代表皺形，由於它們都是隱性，所以用小寫字母來表示。由於這兩個親本都是純合體，所以它們都只能產生一種型別的配子，即：YYRR——YRyyrr——yr二者雜交，YR配子與yr配子結合，所得後代F1的基因型全為YyRr，即全為雜合體。由於基因間的顯隱性關係，所以F1的表現型全為黃色圓形種子。雜合的F1在形成配子時，根據分離規律，即Y與y分離，R與r分離，然後每對基因中的一個成員各自進入到下一個配子中，這樣，在分離了的各對基因成員之間，便會出現隨機的自由組合，即：（1） Y與R組合成YR；（2）Y與r組合成Yr；（3）y與R組合成yR；（4）y與r組合成yr。由於它們彼此間相互組合的機會均等，因此雜種F1（YyRr）能夠產生四種不同型別、相等數量的配子。當雜種F1自交時，這四種不同型別的雌雄配子隨機結合，便在F2中產生16種組合中的9種基因型合子。由於顯隱性基因的存在，這9種基因型只能有四種表現型，即：黃色圓形、黃色皺形、綠色圓形、綠色皺形。它們之間的比例為9∶3∶3∶1。這就是自由組合定律。2、融合遺傳是早期的一種遺傳理論，與顆粒遺傳相對。融合遺傳是1868年由達爾文提出的。它主張兩親代的相對性狀在雜種後代中融合而成為新的性狀而出現，也即子代的性狀是親代性狀的平均結果，且雜合子後代中沒有一定的分離比例。融合遺傳方式是雜交後代的性狀介於兩親本之間，若雜交後代自交，性狀不會分離;若測交再次介於兩者的狀態之間。當時的人們普遍相信融合遺傳，認為後代是父母性狀(或者說血緣)融合的結果，比如黑人和白人通婚後生下的小孩膚色介於中間，如果一個白人到黑人部落生活、繁衍，他的後代的膚色會變得越來越黑，白膚色這種性狀最終會消失。同理可證，一個適應環境的優秀變異也會一代一代地被其他變異稀釋掉，而無法得到傳播。達爾文認為就是類似液體的胚芽融合的結果，且以這種方式傳遞的遺傳性狀的後代中不分離，這個理論目前認為是錯誤的。