僅僅對大學課程來說，水利水電難點。

因為工程類基礎課：高數，英語，理論力學，結構力學，土力學，材料力學，工程材料，大學物理，畫法幾何，cad，工程管理等等基礎課通用

專業課就不一樣了，水利水電：水利水能規劃，水資源管理與應用，工程地質與水文地質，水泵與泵站，水工建築物，水工鋼筋混凝土，水力學，水利學（兩者不同），工程水文學，水工鋼結構，水輪機與發電機，電器學，地下水利用，甚至氣象學，節水灌溉技術，水電站，等等很多很系統，也不太常見自然難點。

土木工程（非道路橋樑方向）主要注重房屋建築，工民建，混凝土及砌體結構、混凝土結構設計原理、基礎工程、建築結構檢測技術、土木工程施工等等，房屋建築學對簡單。

對於施工技術來說：做過水利樞紐工程的，水庫的，水電站的涉及到很多技術：大體積混凝土，高邊坡支護，特種混凝土，灌漿，圍堰，大型爆破，橋樑，路等等而且很多異形結構再加上附屬的管理樓。一般做過這些的，結合房建規範101圖集什麼的，再熟悉下驗收程式，各地市監督程式，做土木工程房建不成問題。但要是讓做過房建的去做水利轉型可能還要難點。

水利水電工程的政府驗收涉及部門分為水利工程驗收～對應水行政主管部門或者流域管理結構。水電工程～能源局。

土木工程涉及的主要是城市相應管理部門，消防，公安，質監站等。

不過任何工程驗收都是程式上的，程式是小事不是兩者難度的本質區別。難度本質區別在於內在特點不同。