計算市場平均市盈率的基本公式主要有兩種：

1、首先計算各個股的市盈率,然後以其股本數為權重進行加權平均;

2、不計算個股的市盈率,用市場的總市值除以總收益得平均市盈率.兩者的計算結果會有一定差異,尤其是當市場中有較多利潤很少或虧損公司時,差異較大.

對於是否將利潤很少或虧損的公司納入市場平均市盈率的計算，人們有不同的意見，建議納入的人認為：平均市盈率反映的是整個市場的事種客觀狀態，因而所有的公司都應該納入；

不同意納入的人認為，對於利潤很少的公司，即使股價並不高，其市盈率也可能很高（比如，股價為5元，每股稅後利潤0.001元，則市盈率為5000）。

若將其納入平均市盈率的計算，很可能會對計算結果產生異常的拉動作用。而對於虧損的公司,因其市盈率是個負值，沒有明確的經濟意義，從而不應納入。

擴充套件資料：

平均市盈率與總股本和流通股本都有關，總股本和流通股本越小，平均市盈率就會越高，反之，就會越低。因此，如果是以小股本公司為主的市場，它的合理市盈率就應高一些。同時市盈率應與股本結構掛鉤。如果股份是全流通的，市盈率就會低一些，反之則會高一些。

因為資產的流動性會增加資產的價值，流通股在股本中所佔的比例越小，流通股與非流通股價格差異越大，流通股的平均市盈率就越高。目前的中國市場，非流通股佔到總股本的三分之二，在它們沒有流通的情況下，流通股的市盈率較高，也是正常的。