會的。副油箱一般都是掛載在機翼下的，通常那種兩頭都尖的“大炸彈”就是副油箱，與增加飛行阻力一樣掛載副油箱無法避免的也會增加雷達回波，所以會影響飛機的隱身效能。

戰鬥機搭載副油箱肯定會增大其雷達反射面積，如果是隱身戰鬥機的話，搭載副油箱無疑也會降低其隱身效能。但是，一般情況下，在近入戰鬥（或者在進入敵方空域）之前都會把副油箱拋掉，以減小對戰鬥機的機動性和隱身性的影響！殲-20掛載4個副油箱進行雙機編隊試飛同時掛載4個副油箱以及2個保形副油箱的F-35戰鬥機（不愧是“肥電”）！同時掛載2個大容量副油箱、機體“保形副油箱”以及大量彈藥的以色列F-16I戰鬥機！

現代戰鬥機的外形設計已經根據空氣動力學要求高度簡化，為了提升戰鬥機的巡邏、作戰半徑，普遍都會裝備副油箱（當然，副油箱也是經過精心設計的），特殊情況下還會同時掛在多個副油箱，也有個別戰鬥機採用與機身融合一體的“保形副油箱”，在提升作戰半徑的同時，儘量降低對飛行效能和雷達反射訊號的影響。掛載3個副油箱和“保形副油箱”的F-16I戰鬥機沙特空軍的F-15SA戰鬥機，掛載了2個大容量副油箱，而且其兩側翼根處還設有保形副油箱！

從第四代戰機開始，為了最大限度降低雷達發射訊號，普遍採用內建彈倉，使得機體內的空間十分緊張，但是，仍然保留了掛在副油箱和外接武器掛架能力。一旦掛載副油箱或者外掛武器，那麼就破壞了四代機整體隱身佈局，隱身效果必然大打折扣，因此，針對四代隱身戰機還會設計低雷達反射的隱身副油箱（或者塗敷雷達吸波材料等）。掛載2個副油箱飛行的F-22戰鬥機網上曝出的殲-20掛載4個大容量副油箱試飛照！

掛載副油箱是有效提升戰鬥機作戰半徑最簡潔的方式，而且可以根據任務的不同靈活調整掛載方式，只要使用方法得當，基本上不會影響戰鬥機的作戰效能。當然，如果隱身戰鬥機掛著幾個碩大的副油箱肯定會影響隱身效能，但肯定不會帶著副油箱投入戰鬥！

飛機的隱身效能受外形影響極大。如果掛載副油箱的話，飛機的雷達反射截面會急劇增大，實質上就會失去隱身能力。當然，保形油箱影響較小，但同樣會有影響，而且保形油箱不可拋棄，會影響飛機效能。

隱形戰機外掛副油箱的話肯定會影響到它的隱身效能。隱形戰機想要實現雷達“隱形”，主要還是依靠獨特的外形設計以儘可能的降低雷達反射截面積，而任何外露的突出部位，比如說翼下武器彈藥、外掛副油箱、電子干擾吊艙等，不僅會對飛機造成較為明顯的空氣阻力、它們實際上算是對氣動佈局造成了破壞，而且也會增加飛機的雷達反射截面積（RCS）。

諸如F-22、F-35、B-2等隱形飛機，它們在設計的時候也會刻意的避免出現相交的直角表面，垂直尾翼則向外傾斜，武器彈藥內建掛載，彈艙門在彈藥釋放前都要保持在關閉狀態，如需使用時開啟之後立即關閉，而開啟彈艙門也會影響到飛機的隱身效能。當然了，像F-35A隱形戰鬥機，該機的內部燃油量就能達到18500磅（約8.4噸），大多數情況下也不會用外掛副油箱來增加航程。

戰鬥機目前影響隱身能力最大的因素就是雷達反射截面積，增加了副油箱就代表原來的戰鬥機的雷達反射截面積的增加，這樣就增加了被敵方雷達發現的可能性。

作為隱身戰鬥機正常情況下是不配備副油箱的，到目前為止服役的隱身戰鬥機中除了美國的F-22A在跨洋飛行時攜帶副油箱，別的F-35和殲-20都很少用用到副油箱。這是由於當時F-22A研製的時候過多的考慮雷達隱身，其機身設計比較矮小。

戰鬥機的設計就算是普通的傳統型號也會特別關注雷達反射截面積，更何況那些最新研製的型號了。

戰鬥機搭載副油箱不僅影響雷達反射截面積，而且還影響機動能力。所以在空戰的時候都會首先拋棄副油箱。