細胞克隆形成率即細胞接種存活率，表示接種細胞後貼壁的細胞成活並形成克隆的數量。貼壁後的細胞不一定每個都能增殖和形成克隆，而形成克隆的細胞必為貼壁和有增殖活力的細胞。克隆形成率反映細胞群體依賴性和增殖能力兩個重要性狀。
平板克隆形成和軟瓊脂克隆形成主要是實驗步驟和方法的區別和適用情況的區別。
平板克隆形成實驗基本步驟：
1、取對數生長期的各組細胞，分別用0.25%胰蛋白酶消化並吹打成單個細胞，並把細胞懸浮在10%胎牛血清的DMEM培養液中備用。
2、將細胞懸液作梯度倍數稀釋，每組細胞分別以每皿50、100、200個細胞的梯度密度分別接種含10mL 37℃預溫培養液的皿中，並輕輕轉動，使細胞分散均勻。置37℃ 5% CO2及飽和溼度的細胞培養箱中培養2～3周。
3、經常觀察，當培養皿中出現肉眼可見的克隆時，終止培養。棄去上清液，用PBS小心浸洗2次。加4%多聚甲醛固定細胞5mL固定15分鐘。然後去固定液，加適量GIMSA應用染色液染10～30分鐘，然後用流水緩慢洗去染色液，空氣乾燥。
4、將平皿倒置併疊加一張帶網格的透明膠片，用肉眼直接計數克隆，或在顯微鏡（低倍鏡）計數大於10個細胞的克隆數。最後計算克隆形成率。
克隆形成率 =（克隆數/接種細胞數）×100%
平板克隆形成試驗方法簡單，適用於貼壁生長的細胞。適宜底物為玻璃的、塑膠瓶皿。試驗成功的關鍵是細胞懸液的製備和接種密度。細胞一定要分散得好，不能有細胞團，接種密度不能過大。
軟瓊脂培養克隆形成試驗基本步驟：
(1)取對數生長期細胞，用0.25%胰蛋白酶消化並輕輕吹打，使之成為單細胞，作活細胞計數，用含20%胎牛血清的DMEM培養液調整細胞密度至1×106細胞/L。然後根據實驗要求作梯度倍數稀釋。
(2)用蒸餾水分別製備出1.2%和0.7%兩個濃度的低溶點瓊脂糖液，高壓滅菌後，維持在40℃中不會凝固。
(3)按1:1比例使1.2%的瓊脂糖和2×DMEM培養基(含有2×抗生素和20%的小牛血清)混合後，取3mL混合液注入直徑6cm平皿中(10cm平皿加7～10mL)，冷卻凝固，可作底層瓊脂置CO2溫箱中備用。
(4)按1:1比例讓0.7%的瓊脂糖和2×DMEM培養基在無菌試管中相混以後，再向管中加入0.2mL的細胞懸液，充分混勻，注入鋪有1.2%瓊脂糖底層平皿中，逐形成雙瓊脂層。待上層瓊脂凝固後，置入37℃ 5%CO2溫箱中培養10～14天。
(5)把平皿放置在倒置顯微鏡下，觀察細胞克隆數。計算形成率。 軟瓊脂培養法常用檢測腫瘤細胞和轉化細胞系。試驗中瓊脂與細胞相混時，瓊脂溫度不宜超過40℃。接種細胞的密度每平方釐米不超過35個，一般6cm的平皿接種1000個細胞。正常細胞在懸浮狀態下不能增殖，不適用於軟瓊脂克隆形成試驗。
軟瓊脂集落形成率實驗(軟瓊脂克隆)
將1.2％低熔點瓊脂糖與2×細胞培養基以1:1 的體積比混合製備0.6％的底層瓊脂，6 孔板中每個孔1.4ml 溫室凝固，取對數期細胞，胰酶消化後吹散成單個細胞懸液，計數，並調細胞濃度為10000 個/ml，將0.6％低熔點瓊脂糖與2×細胞培養基以1:1 的體積比混合，製備0.3％的上層瓊脂，每孔加1ml 上層瓊脂和100ul 單細胞懸液（約1000cell/well)，混勻，室溫凝固。置於37℃，5％CO2 的細胞培養箱中培養2－3 周，計數含50 個細胞以上得克隆，計算細胞集落形成率，SpotII 採集影象。
細胞克隆形成率即細胞接種存活率，表示接種細胞後貼壁的細胞成活並形成克隆的數量。貼壁後的細胞不一定每個都能增殖和形成克隆，而形成克隆的細胞必為貼壁和有增殖活力的細胞。克隆形成率反映細胞群體依賴性和增殖能力兩個重要性狀。
平板克隆形成和軟瓊脂克隆形成主要是實驗步驟和方法的區別和適用情況的區別。
平板克隆形成實驗基本步驟：
1、取對數生長期的各組細胞，分別用0.25%胰蛋白酶消化並吹打成單個細胞，並把細胞懸浮在10%胎牛血清的DMEM培養液中備用。
2、將細胞懸液作梯度倍數稀釋，每組細胞分別以每皿50、100、200個細胞的梯度密度分別接種含10mL 37℃預溫培養液的皿中，並輕輕轉動，使細胞分散均勻。置37℃ 5% CO2及飽和溼度的細胞培養箱中培養2～3周。
3、經常觀察，當培養皿中出現肉眼可見的克隆時，終止培養。棄去上清液，用PBS小心浸洗2次。加4%多聚甲醛固定細胞5mL固定15分鐘。然後去固定液，加適量GIMSA應用染色液染10～30分鐘，然後用流水緩慢洗去染色液，空氣乾燥。
4、將平皿倒置併疊加一張帶網格的透明膠片，用肉眼直接計數克隆，或在顯微鏡（低倍鏡）計數大於10個細胞的克隆數。最後計算克隆形成率。
克隆形成率 =（克隆數/接種細胞數）×100%
平板克隆形成試驗方法簡單，適用於貼壁生長的細胞。適宜底物為玻璃的、塑膠瓶皿。試驗成功的關鍵是細胞懸液的製備和接種密度。細胞一定要分散得好，不能有細胞團，接種密度不能過大。
平板克隆形成試驗方法簡單，適用於貼壁生長的細胞。適宜底物為玻璃的、塑膠瓶皿。試驗成功的關鍵是細胞懸液的製備和接種密度。細胞一定要分散得好，不能有細胞團，接種密度不能過大。
軟瓊脂培養克隆形成試驗基本步驟：
(1)取對數生長期細胞，用0.25%胰蛋白酶消化並輕輕吹打，使之成為單細胞，作活細胞計數，用含20%胎牛血清的DMEM培養液調整細胞密度至1×106細胞/L。然後根據實驗要求作梯度倍數稀釋。
(2)用蒸餾水分別製備出1.2%和0.7%兩個濃度的低溶點瓊脂糖液，高壓滅菌後，維持在40℃中不會凝固。
(3)按1:1比例使1.2%的瓊脂糖和2×DMEM培養基(含有2×抗生素和20%的小牛血清)混合後，取3mL混合液注入直徑6cm平皿中(10cm平皿加7～10mL)，冷卻凝固，可作底層瓊脂置CO2溫箱中備用。
(4)按1:1比例讓0.7%的瓊脂糖和2×DMEM培養基在無菌試管中相混以後，再向管中加入0.2mL的細胞懸液，充分混勻，注入鋪有1.2%瓊脂糖底層平皿中，逐形成雙瓊脂層。待上層瓊脂凝固後，置入37℃ 5%CO2溫箱中培養10～14天。
(5)把平皿放置在倒置顯微鏡下，觀察細胞克隆數。計算形成率。 軟瓊脂培養法常用檢測腫瘤細胞和轉化細胞系。試驗中瓊脂與細胞相混時，瓊脂溫度不宜超過40℃。接種細胞的密度每平方釐米不超過35個，一般6cm的平皿接種1000個細胞。正常細胞在懸浮狀態下不能增殖，不適用於軟瓊脂克隆形成試驗。
軟瓊脂集落形成率實驗(軟瓊脂克隆)
將1.2％低熔點瓊脂糖與2×細胞培養基以1:1 的體積比混合製備0.6％的底層瓊脂，6 孔板中每個孔1.4ml 溫室凝固，取對數期細胞，胰酶消化後吹散成單個細胞懸液，計數，並調細胞濃度為10000 個/ml，將0.6％低熔點瓊脂糖與2×細胞培養基以1:1 的體積比混合，製備0.3％的上層瓊脂，每孔加1ml 上層瓊脂和100ul 單細胞懸液（約1000cell/well)，混勻，室溫凝固。置於37℃，5％CO2 的細胞培養箱中培養2－3 周，計數含50 個細胞以上得克隆，計算細胞集落形成率，SpotII 採集影象。