首先到日本讀研和哪個專業沒有特別關係、基本就是一下兩個方式：

1、在國內聯絡導師辦理研究生、也就是大學院旁聽生，之後參加大學院入學考試、合格後讀碩士。重要的是日語、英語和研究計劃書。

2、去語言學校過渡後，不必再經過研究生階段、可以直接考大學院讀碩士。

以上不管哪個方式，其實都是過渡而已、到時候都是同樣參加大學院的入學考試、通過後讀修士，也就是真正的碩士。

研究生相對好處在於、提前知道去哪所大學、如果和導師相處很好、那麼透過筆試後相對有利。壞處在於、1、辦理費用高、和學費加起來是語言學校的1.5倍以上。2、如果自己自學能力比較差、或者萬一和導師相處不好，基本肯定考不取。反而之後只能去差的大學或者重新讀語言學校。

所以目前題主可以1、安心學好專業 2、日語繼續提升 3、以後要考名校的話、那麼建議準備託福 4、等大三結束的時候、看自己的實際情況選擇哪個方式，準備留學具體申請事宜。

不要擔心學校和專業的問題。先搞好日語和英語，整出成績來後面的事情就是事在人為。

日本的考研選專業的話，目前對題主來說，選理工科類的會比較好。一方面語言要求沒那麼高，語言方面的壓力會小一點。另外比較好就業。如果對數學比較有信心的話，可以選cs，ee。如果對數學比較沒信心可以考慮經營工學。

學校方面，多所舊帝大和強勢私立都可以考慮。