題主對鎮遠的改裝有誤解，表達也有問題。我猜題主想問的是，日本為什麼要在鎮遠放艦載魚雷艇的地方增加炮位？

定遠級鐵甲艦在德國時的照片，可以看到第二個煙囪和後桅杆之間有一艘小型魚雷艇，在另一面同樣有一艘魚雷艇（上圖），所以現在威海的複製艦定遠也同樣搭載了2艘魚雷艇（下圖）

定遠級鐵甲艦在建造時，就包含了每艦2艘艦載魚雷艇。以大型戰艦搭載魚雷艇的做法一直延續到第一次世界大戰，即使無畏戰列艦也有艦載魚雷艇。不過實戰中這種魚雷艇能發揮作用的機會極少，所以一戰之後就消失了。

定遠級鐵甲艦回國後，魚雷艇就被卸走了，原來的位置改放了兩艘舢板（上圖），而甲午戰爭時期，為避免舢板中彈後碎片飛散造成二次傷害，把舢板拆掉了（下圖）

李鴻章在這方面倒頗有前瞻性，他一開始就沒打算讓這種魚雷艇作為鐵甲艦的附屬品，而是準備作為普通魚雷艇使用。其實，鎮遠所謂的艦載魚雷艇，自從建成回國後，就被卸下來，配屬給了魚雷營，從此再也沒有被鎮遠搭載過。後來在威海衛之戰中，一艘沉沒，一艘被俘，日本海軍把被俘的這一艘改名為第二十八號水雷艇，也沒有作為艦載魚雷艇使用。

日本的改裝除了重新裝上舢板外，就是在多餘的位置（因為舢板比魚雷艇小多了，所以空餘不少位置）安裝了耳臺炮（下圖）

既然沒有艦載魚雷艇，鎮遠這塊地方自然就空著了。空著太浪費，日本人覺得鎮遠火力不足，而要加裝火炮，也只有這塊地方最合適，於是就在這個位置增添了兩個突出的耳臺，加裝了兩門阿姆斯特朗六吋速射炮。

至於為什麼不在其他地方添設火炮，也是因為鎮遠獨特的左右對稱主炮臺佈置方式，使得為了保證主炮射擊角度，大多數地方都沒有辦法安裝火炮，要不然就會被主炮的炮口暴風波及。實際上日本人加裝耳臺炮後，主炮向後射擊的角度就大為受限了。這也是無奈之下的犧牲。

所以，不是日本人異想天開，只是因地制宜罷了。

定遠級近海防禦一等鐵甲艦最大的硬傷就是副火力太弱，日本人俘虜鎮遠艦後，之所以在兩舷耳臺架設了兩門6英寸（152mm）阿姆斯特朗型速射炮，就是為了彌補副火力薄弱的空檔。雖然到了1894年，鐵甲艦攜帶魚雷艇的實戰意義並不算太大，但小日本也並沒有取消魚雷艇。

上圖就是小日本俘虜鎮遠艦後，對鎮遠艦的武備改裝圖，最明顯的地方莫過於艦舯後部的兩門152毫米阿姆斯特朗式速射副炮

小日本在俘虜了鎮遠艦後，在原有的武備基礎上，保留了四門305毫米克虜伯主炮，在靠近艦艉的地方增加了耳臺並加裝了兩門6寸阿姆斯特朗式速射炮，但這樣改裝的後果就是305毫米主炮無法向後射擊。除此之外，取消了原有的37毫米機關炮，增加了兩門57毫米機關炮、六門47毫米哈奇開斯機關炮。小日本甚至還為鎮遠加裝了三具356毫米魚雷發射器，鎮遠艦上攜帶的兩艘魚雷艇也改成了日本的26號型魚雷艇。除了增強了鎮遠艦的整體火力，小日本還為鎮遠更換了鍋爐，更換鍋爐後的鎮遠航速可以達到10節左右。

北洋海軍的“鎮遠”艦被日軍俘虜後，並不存在什麼在魚雷艇裡增加炮位之類的事情。

“鎮遠”是北洋海軍1880年代從德國伏爾鏗造船廠訂造的2艘“定遠”級鐵甲艦之一，在1885年從德國回中國交付時，艦上暫時性地運輸了魚雷艇，回國後魚雷艇即解除安裝，艦上原有的搭載魚雷艇的設施也全部拆除。

（經歷1895年8月至1896年7月改造後的“鎮遠”）

甲午戰爭末期的1895年2月17日，日軍佔領威海劉公島時繳獲了“鎮遠”艦，1895年3月16日編入日本海軍艦籍，隸屬橫須賀鎮守府，艦種定為“第一種軍艦”。“鎮遠”先是在日軍佔領下的旅順船塢進行了簡單的修理維護，而後在7月4日返回日本本土，日方對“鎮遠”的改造（主要是武備改造）開始於1895年的8月，為期一年，由橫須賀鎮守府造船部實施。

（日本海軍時期“鎮遠”上最重要的改造就是在後桅杆附近各增設了1門152毫米的速射炮）

主要的改造情況如下：

1、艦上原有的4門305毫米口徑克虜伯主炮保留。

2、艦上首尾的2門150毫米口徑克虜伯副炮拆除，替換成2門152毫米口徑40倍徑的阿姆斯特朗速射炮，相應的對炮位、炮罩更換重做（艦首副炮仍然採用封閉式炮罩，艦尾改用炮盾）。

3、在軍艦後桅杆附近的甲板室兩側各拓展出一個半圓形的基座，各安裝1門152毫米口徑40倍徑阿姆斯特朗速射炮。

4、“鎮遠”原有的機關炮全部拆除，替換成日本海軍制式的47毫米口徑單管機關炮10門、37毫米口徑機關炮2門。

5、對飛橋進行改造，在飛橋甲板上增設大型的駕駛室。

（“鎮遠”艦改造前後的俯檢視對比，可以留意飛橋、後桅杆兩側以及艦尾副炮是主要的變化位置）