李自成山海關一戰失利後，帶著殘部一路被吳三桂和清軍追趕，逃回北京城是唯一的選擇，因為沿途無險可守。

1644年4月26日，李自成終於回到北京，為了給自己帶來好運，他在匆匆忙忙中登基做了皇帝。他真的是恨透吳三桂，4月27日把吳三桂的繼母、弟弟、妹妹和全族共34口全部處死，屍體就扔在王府二條衚衕，而吳三桂的老爹吳襄早在軍敗的時候被斬首。4月28日，吳三桂部已經逼進北京城，城內的明朝官員決定二度反水，投靠吳三桂。

雖然李自成覺得北京城難以守住，但是他和手下的人還捨不得京城的繁華，於是背靠堅城做最後一搏。李自成讓劉宗敏、唐通、李過、李巖等在城外部署戰陣，建立連營18座。吳三桂率領所部強攻，隨後清軍馳騁而援，大戰不到半日，大順軍18座營寨就丟了8座。

李自成一看戰局，多年的征戰讓他明白守不住了，於是他就放火燒宮城，帶著明太子朱慈烺西逃，手中尚有兵力數萬。

李自成一路西逃，前有原降明軍的倒戈反水、後有吳三桂和清軍追擊，大順軍官兵們疲於奔命、鬥志全無，傷亡、逃跑、投降，李自成帶的人越來越少。

退到河北真定的時候，李自成決定要跟吳三桂進行一次大戰，因為他太需要一次勝利來鼓舞士氣了。當時的吳三桂部隊正駐紮在定州。

李自成的大順軍和吳三桂爆發定州、真州兩戰。大順軍再次遭受重大損失，身在戰場第一線的李自成也中了箭，而吳三桂的部隊和清軍也是傷亡慘重。不過戰後，大順軍主力撤出河北，那麼北京以北，居庸關內外各地，以及天津、真定等處都降了清。

李自成進入山西境內，在各戰略要地佈置兵力，堵截追兵。部署完畢後，他就返回西安，企圖復興大業。不過，後來他出於整體戰略考慮，放棄山西，集中軍力以備大用。

接下來，大順軍跟清軍爆發終極一戰——潼關對決。大戰於12月29日打響，李自成手下大將劉宗敏首戰不利，隨後的幾次反攻都被清軍的多鐸部擊退。

很快，另外一支來自北路的清軍接近西安，李自成被迫從潼關撤回主力，返回西安。留守潼關的將領馬世耀一看，這不是等著被清軍砍嗎，於是一咬牙、一跺腳，就把潼關獻給清軍。

這是一次關鍵性的戰役，雙方鏖戰10多天，結局是大順軍失敗。潼關失守，意味著西安沒有了屏障。

後來，清軍多鐸部離開潼關，兵侵西安，李自成沒怎麼打，就帶人撤出西安。

接下來，李自成和清軍就沒有大規模的戰役發生了，因為他很快就被一群鄉勇給打死了。

話說李自成在興國州（湖北陽新縣）附近的富池口被清軍打敗後，帶著3萬殘軍向西南方向撤退。

這次不知道哪道靈光亮了，李自成居然讓手下人帶著主力部隊撤往江西，自己帶著28騎翻越九宮山到江西，再和大部隊會合。

他運氣實在太差，在路經九宮山下的李家鋪河灘的時候遭遇小股清軍，部下為掩護他逃跑，28騎全部戰死。李自成孤家寡人翻越山嶺，結果被當地的鄉勇趕到，一代梟雄被活活打死。

山海關之戰後，李自成和清軍打了兩次比較大的仗，陝北之戰和潼關之戰，不過知名度不高，很多人不瞭解。

李自成山海關之戰主力損失慘重，之後一直未能恢復。很多人認為李自成有百萬大軍，其實李自成比較有戰鬥力的部隊也就五營的六萬人左右。山海關之戰李自成兵力也只有六萬人，包括五營的大部分兵力。主力嚴重受損後，李自成實力一直未恢復，之前投降的明軍見李自成戰敗也基本投降了清軍，重新成為李自成的敵人。

（李自成）

之後清軍進攻陝西時，因清軍的輕敵李自成其實有一定獲勝的機會。當時多爾袞認為李自成已經不足為慮，派遣阿濟格從陝北進攻李自成，多鐸進攻南明。阿濟格在陝北的進展很不順利，被順軍將領高一功擋住，李自成則準備動員所有力量增援陝北。如果李自成能夠順利到陝北，戰勝阿濟格有一定機會。

但這時在河南的李自成軍取得了一次勝利，順軍在河南懷慶擊敗了一隻清軍，擊斃清將金玉和，清軍損失數千人（主要是漢奸軍）。多爾袞重新重視起李自成，命令多鐸轉向從潼關進攻陝西。

實力已經不大的李自成軍對付一路清軍有點機會，對付兩路清軍自然毫無機會，在潼關毫無懸念的戰敗，清軍佔領陝西，一路追擊李自成到湖北，李自成在湖北九宮山意外被地方武裝所殺。

李自成被殺後，順軍餘部歸降南明，被改變為忠貞營，繼續抗清。後來順軍餘部為主的一部分抗清勢力進入三峽地區，形成夔東十三家，堅持抗清到康熙初年。

1664年（康熙三年），李自成侄子李過的義子李來亨，在清軍圍攻下最終失敗，壯烈自焚。李來亨是在大陸打著明朝旗號堅持抗清的最後一隻較大規模的武裝，是當之無愧的英雄男兒而當年鎮壓李自成的明軍們，此時都變成了清軍。

（李來亨）