第一次技術不成熟，可能沒研發到讓他們有自我意識，即使研發出來了，根據後面故事的情況，兩人很容易掙脫穢土轉生的束縛（後面二代沒掙脫是因為有初代細胞加強控制，初代麼，第二次都估計完全控制不住，所以把大蛇丸差點嚇尿）。你要讓有自主意識的初代二代去毀滅這兩人一生心血建立的木業？找死吧？這問題為啥要問？

第一次只需要操控一代二代的傀儡就夠三代打的了，第二次是佐助需要知道一切真相故而保留意識！第二次由於有最優祭品白絕精度上大大提高，同時保留意識導致初代隨時掙脫，二代險些失控的風險…

第一次出來的時候，壓根不會知道他還會第二次出來。因為那時候就沒有那個設定。

第二次出來的時候，二代肯定知道能夠解開術，但是兜知不知道，我不知道，斑肯定也不確定兜知不知道！所以為了萬無一失，斑在最後時刻，兜被伊邪那美強控住（當然斑並不知道）無法限制斑的行動，在這個基礎上，解除穢土轉生。

綜上——第一，穢土轉生的施術者是可以控制傀儡行動的。第二，穢土轉生的控制度和完美度是矛盾的。即——完美度越高，傀儡越能發揮生前能力。但是召喚出來的爸爸越牛逼，越不容易控制！比如柱間那種變態可以強破大蛇丸的控制。

因此，二代第一次出來，可以強行解釋為術的完美度不高，初二代實力大打折扣。二代第二次出來，大蛇丸專門針對強化過控制！雖然初代依舊免疫……

而對應的斑，在沒有真正輪迴眼（穢土身為假）之前，實力是不如柱間的。一旦他有這個念頭被兜發現並且打斷了，那他連裝逼的機會都沒有了。所以他只有在最後的時候，背水一戰，嘗試解除穢土轉生。

很顯然，樓主也是被火影吸引的一個同道，那麼我來說說你的疑惑吧！

咱們可以看看大蛇丸第一次轉生初代、二代時的狀況，由於穢土轉生時需要祭品，所以大蛇丸是把自己的兩個手下給獻祭了，這兩個手下的實力能有多強？

初代二代就像是大羅神仙附身到了泥巴里，載體不行，十成實力發揮不出來一半，所以才會被大蛇丸給控制住了，不然隨便一個出來不就能拖住三代火影了？

第二次穢土轉生為什麼不能控制呢？

首先，是因為載體，祭品是初代木遁細胞製作出來的白絕，這種細胞本身非常的強大，而且和初代契合度最高，所以初代的實力能夠接近生前水平。

但是，並不是說穢土轉生對初代和二代就沒用了，我們看看動漫裡面大蛇丸和佐助的對話，就能看出來，大蛇丸還是能夠束縛住二代火影的，但是沒辦法限制初代！

而且，接近生前實力的兩人，如果真的動手，甚至能夠在瞬間絕殺大蛇丸，所以大蛇丸才不敢試圖控制，因為結果太恐怖了。

當然，也不排除當時大蛇的確需要初代而二代的戰力，如果真的用穢土轉生控制的話，兩人的靈活性肯定受到影響，不利於後面的助陣，所以大蛇丸才假裝自己無法控制兩人的樣子。

這麼說應該明白了吧？

第一次穢土轉生的時候，二代火影也有自我意識，並不是從一開始就被控制的。

在大蛇丸入侵木葉的時候，大蛇丸使用穢土轉生，初代二代從棺材裡出來時確實看起來像無意識的傀儡，但他們馬上就跟三代火影對話了：

甚至當時二代火影還轉頭評價了大蛇丸，稱他是個了不起的年輕人，初代火影還很無奈地說這下就必須要跟猿飛交手了，因為他明白接下來會發生什麼：

果然，大家聊完天之後，大蛇丸就把帶有符咒的苦無塞進了初代和二代的腦袋裡：

從這一刻開始，初代和二代才開始完全受到大蛇丸的控制，失去了自我意識。旁邊的暗部也進行了解說，說初代二代腦袋裡被埋入了符咒，因此抹殺了人格，成為完全的殺戮傀儡：

第四次忍界大戰中，大蛇丸再次進行了穢土轉生，這次轉生的物件也包括初代和二代。二代出來之後甚至說了一句“又是大蛇丸啊”，很明顯他對上一次的穢土轉生是有印象的：

之後二代火影想要自己獨自出戰，他說這一次穢土轉生比上一次更厲害，讓自己擁有更接近巔峰時期的力量，這個說法也證實了二代火影上次被轉生時擁有自我意識：

只不過這次二代失算了，他沒想到大蛇丸移植了初代的細胞，控制能力變得比以前更強，自己雖然沒有被埋入符咒但也依然無法反抗大蛇丸的控制……

所以從這些細節來看，大蛇丸第一次穢土轉生和第二次穢土轉生，都讓二代火影以自我意識來到了人間，只不過第一次的時候，大蛇丸轉生後不久就抹掉了二代的意志，第二次由於大蛇丸本身能力變強，不再需要抹掉二代的意志了。