您這種情況，我還是建議單個逐一排除。

1.檢查變速器和換擋機構是否完好

在不啟動發動機的情況下，踩下離合，依次掛每一個擋位，如果都能順利掛入，說明換擋系統沒有問題。

2.檢查離合器是否完好

啟動發動機，踩下離合，將檔位掛入1擋，鬆開離合，看發動機的動力會不會傳遞到變速器上。

3.檢查變速器換擋同步器是否損壞

將車上舉升機，啟動發動機，像正常開車一樣，依次從1擋換到5擋，再從5擋換到1擋，看每個擋位是否都能順暢的掛入，如果只是出現在某兩個擋位換擋困難，就可以確定是這兩個擋位之間的同步器出現問題，如果是每個擋位都不好掛，結合前期第1點，靜態測試時，變速器每個擋位能順利掛入的話，可以確定是離合器分離不徹底，導致的擋位不好掛。

根據你的描述，還有我的猜測，不知你對離合器的相關部件，是否進行了全面的檢查，發動機在熄火時，變速箱是否能夠順利的掛檔，如果你做了全面檢查，能否保證你檢查的每個部位都是正常的，如果你對離合器踏板的機械部分，離合器總泵或離合器拉線，離合器分泵，分離軸承，分離撥叉，離合器膜片離合器壓盤以上部件，檢查後確實正常的話，按照人們的慣性思維，肯定會判定變速箱裡面的故障，諸如同步器齒環，齒輪等故障，此時對有經驗的修理師傅來說，往變速箱裡有故障的想法，就應該有此先暫時打住，就要檢查一個非常不起眼的，很容易被忽視的，某些修理工也不知道的，汽車理論家更想象不到的，大部分人都難以理解的地方（絕招來了），那就是變速箱輸入軸的前端，與曲軸的後端連線處的輸入軸定位軸承，這個飲料瓶蓋大小的軸承非常重要，這個軸承是靠潤滑脂潤滑，而且從外部根本就沒有辦法進行保養加油，給他進行保養加油，必須拆卸變速箱，這個軸承是給主動軸（也稱輸入軸）的前端進行同心定位的，這個軸承只起一個同心定位，輸出在裡面轉動的作用，輸入軸的前端插入曲軸的後端軸承內，透過這個鑲嵌在曲軸後端的軸承，輸入中可以自由的轉動，但曲軸的旋轉絕對不可以帶動輸入軸轉動，雖然兩個軸在一個同心上，除了定位以外，它們兩者之間的相互轉動都不能有關聯，既你轉你的，我轉我的，問題的關鍵來了，如果這個軸承長期缺乏保養潤滑，加之有時候車輛涉水，這個軸承就會沾上灰塵，潤滑脂乾澀，它就會產生一定的鏽蝕，此時這個軸承不能起到很好的滾動旋轉作用，甚至失去作用，此時曲軸的旋轉，就會干擾到輸入軸的旋轉，因為定位軸承鏽死，再踩下離合器時，離合器壓盤將動力分開，此時輸入軸應該不轉動的，但由於導向軸承鏽蝕，曲軸將透過鏽蝕的軸承將動力還會傳遞的輸入軸，使輸入軸繼續轉動，這樣就像沒有切斷離合器一樣，動力還是一樣的會輸出，所以造成擋很難掛，或者根本掛不上，必須更換此導向軸承才行，以上是多年修理得出的結晶，經驗非常寶貴，希望對提問者有所幫助。

這得看是哪種情況了，如果是掛擋時有打齒的聲音，那就是離合器分離不徹底。檢查離合器片和離合器壓盤磨損情況。如果沒有打齒的聲音，就是根本掛不進去，可以試試兩腳離合器，如果兩腳離合器能掛上，那就是變速箱同步器壞了。具體哪個同步器壞了，得拆下來看看

壓板不平整，離合片總成的壓力彈簧沒起作用，應該吊下來檢查，因為已經不是調整的問題了，前期是因為什麼要調整離會片的？這個很關鍵。總之你這個現象可能的原因有很多。

如果車子啟動後掛擋時，只是出現在某兩個擋位換擋困難，可能是這兩個擋位間的同步器有問題，如果是每個擋位都不好掛，可能是離合器分離不徹底造成。

如果離合器分離不清，也就是離合器分離不徹底，會造成所有的檔位掛擋時都會有打齒的聲音、掛擋困難、不好掛擋。

如果發動機飛輪中間的變速箱輸入軸前端定位支撐軸承損壞，也會造成掛擋困難、不好掛擋的情況。正常情況下，不踩離合器時，飛輪與變速箱輸入軸同步轉動，沒有相對轉動；踩下離合器後，飛輪與變速箱輸入軸動力完全分離，各自獨立轉動，有相對轉動，但互不影響；但如果該定位支撐軸承損壞，會造成踩下離合器後，飛輪與變速箱輸入軸動力不能完全分離切斷，且輸入軸前端定位不好，形成跳動，故而會造成掛擋困難、不好掛擋的情況。

如果踩下離合器掛擋時沒有打齒的聲音，就是掛不進去，這時不能硬掛，可以試試兩腳離合，即鬆開離合器，再次踩下，重新掛擋，如果兩腳離合能掛上，說明沒什麼大問題。我的Cruze手動擋車，在掛倒擋時經常會需要兩腳離合才能掛上，找4S店維修，4S店說該型車就這樣，倒擋無同步器，是齧合套，其他檔位有同步器，所以倒擋有時不好掛，其他檔位則好掛。如果還是不能掛上，其他檔位正常，則該檔位的同步器或齧合套齒輪可能有問題，需進一步檢查確認。

車輛出現這種現象，可能是離合器片磨損到極限，離合器壓盤故障、變速箱換擋機構故障、變速箱同步器或同步齒環故障等原因導致的，詳情你也可以諮詢車質網專家答疑版塊或進行問題反饋。