我覺得至少有兩點原因。

一是他自己太作。利用朱元璋不在，自己負責監國的一段時間，一方面肆無忌憚剪出異己，害死了劉伯溫，另一方面，恩威、陰謀並進，把控整個朝廷，把自己搞得比皇帝還要精明，這觸及到了朱元璋的底線。同時他以為他乾的越起勁，朱元璋只會越信任，幼稚到了極點。

二是朱元璋從來都只是利用他。利用他消滅功臣，暗示殺死小明王，別人不屑於乾的陰謀勾當，只要朱元璋一個眼神他就毫無廉恥的去辦，但當朱元璋急用完他，需要殺他收買人心的時候自然也就毫不猶豫。

1380年，胡惟庸被誅殺；1390年，胡惟庸欲圖造反裡通外敵的證據才被拿出來，已死去十年的他謀逆之名坐實，進入《昭示奸黨錄》，並且此案株連甚廣，包括李善長等一堆開國老臣被誅殺殆盡，宰相制度也因此被廢除，權歸六部。

史書上對於胡惟庸謀反一案的記載並不詳實，著名的“雲奇告變”更像是一個傳奇故事。宰相邀請皇帝去家裡，哪怕他心存幹掉皇帝的想法，在皇帝還沒到家之前，恐怕也不敢如此張揚地讓甲冑武裝計程車兵直接聚集在家中院子裡，而且皇帝只要登上城樓就能看見這些人……這樣的部署實在不符合一個丞相的智商。



基於胡惟庸造反一案的重重疑點，學界普遍認為胡惟庸只是朱元璋強化皇權的犧牲品，歷史學家吳晗就曾以《胡惟庸黨案考》一文證明這是一個冤案。

胡惟庸曾經權勢滔天，為非作歹的事情沒有少做。作為一人之下萬人之下的宰相，他私下閱覽各部門奏章，防止不利於自己的言論出現；外國進貢的物品，他也敢瞞著皇帝化為私用；至於貪汙受賄賣官鬻爵的事就更不用說了。只要朱元璋想拿掉他，那是輕而易舉的事情，把柄實在太多了。



但是朱元璋跟他翻臉的時間點拿捏得很巧妙。劉伯溫等開國功臣已經借他胡惟庸的手殺掉了，後來徐達也死了，等到1390年，四大開國功臣之一也就剩下了李善長，於是藉著胡惟庸裡通外敵一案，李善長一脈也被一鍋端掉，此外還有南雄侯趙庸、滎陽侯鄭遇春、永嘉侯朱亮祖、靖寧侯等一共一公二十一侯，明朝的開國功臣此時基本上已被消滅殆盡。朱元璋還乘此機會，直接廢除了宰相制度，皇權獨攬，以絕後患。

可以說，無論胡惟庸是否冤死，他朱元璋是肯定不會留他的。朱元璋要的是大明江山千秋萬代，在他任內就要想方設法把潛在的威脅全部剷除。

胡惟庸確實是被朱元璋殺死的，理由嘛，不重要，朱元璋要殺人還用什麼理由啊，他看中的並不是一個小小的胡惟庸，而是胡惟庸身後的丞相之位，朱元璋廢除丞相的這個想法從他當上皇帝的那一刻起就已經有了，只是時機不到，不能輕易就廢除了這傳了幾百年的制度，所以他在等，終於等來了這個機會，也就是胡惟庸，他總攬大權，拉幫結派，試圖與朱元璋抗衡，同時他也知道朱元璋的為人，“要麼不做，要麼做絕”是朱元璋的人生格言，他害怕鬥不過朱元璋，所以拉上了朝中幾乎所有的大臣，但是讓他沒想到的是，朱元璋根本沒有在意這些事，把所有和他有關係的人都殺了，出手可謂是狠辣，這也是他的行事風格。

朱元璋殺胡惟庸是必然的，朱元璋想廢除丞相之位，而胡惟庸也確實權利過大，威脅到了朱元璋。

明代洪武年間‘胡惟庸案’之主角——胡惟庸，中國最後一個丞相，朱元璋忍其七年不殺，一殺則天下震動。並滅九族，前後株連人數達三萬餘人。之後朱元璋廢左右丞相，中書省 ，職務交由六部，設殿閣大學士為皇帝顧問。加強了中國的中央集權統治。

胡惟庸，安徽濠州人，與李善長老鄉，明代開國功臣之一，建朝以後被朱元璋寵幸，又靠著李善長的關係， 先後兼任左右丞相，一時風頭無兩，為百官之首。

後逐漸驕橫跋扈，獨斷專權 ，生殺廢黜大事往往不報告朱元璋就自己決定，為他以後被滿門抄斬打下良好的領導基礎。凡是各部門的奏章都要先經過他手，對自己有利，就呈上，對自己不利則私自報復。一時許多阿諛奉承，急功近利之人競相投靠。大將軍徐達極度厭惡此人，告訴了朱元璋，導致胡惟庸意圖謀害徐達，後被徐達其守門人揭發，陰謀失敗。由此可見胡惟庸喪盡人心。

後來暗中指示其走狗招兵買馬，糾集一些對朱元璋不滿的人意圖起事。又派人遊說李善長，李善長原先堅決拒絕，後禁不住勸說，說了句讓他全家死無葬身之地的話：‘吾老矣，吾死，汝等自為之。’被胡惟庸不知情的落拉下了水。

後胡惟庸因兒子之死怪罪與其馬伕，私自殺之，朱元璋大怒，要其賠罪，並不許拿錢財贖罪。遂促使胡惟庸加速謀反計劃。

後因占城國來使之事，被人告發陰謀，遂事情敗露，被剝皮充草，下場悽慘。李善長也受其株連，全家被殺。受其株連而死或死後被剝奪爵位的有一公二十一侯。其實胡惟庸死後，事情還沒完全暴露，後來接續的案件逐漸的將其陰謀展現出來，具體事件就不一一敘述了。

總之，胡惟庸之案，很多人說是個藉口，也有後代學者考證此謀反案為冤案。但不管如何，朱元璋藉此廢除丞相之位，以達到中央集權，強化統治的目的。而對胡惟庸而言，這是在為自己走向滅亡鋪路。自古以來皇權神聖，豈時一般人所能觸碰?要麼粉身碎骨，要麼脫胎換骨，胡惟庸不自量力，終落得個淒涼下場。