曉組織是火影忍者中一個五大國之外最強大的忍者組織。它的核心成員大多都是各國的S級叛忍組成的。而這些叛忍其實沒有幾個是和曉組織是一條心的。每個人加入曉組織都有各自的原因。劍客覺得當曉組織不能滿足他們的需求的時候，大部分人都會像大蛇丸一樣叛逃曉組織的。畢竟這些人都是有叛逃前科而且實力十分強大的。

一、曉組織首領佩恩十分強大，擁有傳說中六道仙人的眼睛輪迴眼。從究極風暴中的劇情我們可以得知，曉組織的成員很多都是由組織的人邀請來的，而能被曉組織看上的叛忍實力都十分厲害，脾氣自然也不是很好。可以說曉組織的成員大半都是捱了一頓揍才加入的曉組織。本身作為叛忍就已經被五大國通緝，再招惹打不過的曉組織，還不如加入進去。

二、利用曉組織的資源完成自己的夢想。曉組織很多人都是因為自己的追求才叛逃的村子，但是孤身一人想要完成自己的追求太難了。比如角都一個人做賞金任務賺錢肯定比不上有曉組織情報賺錢來得快。蠍進行各種傀儡實驗的材料也可以利用曉組織來收集。

三、曉組織的管理十分寬鬆。曉組織對於這些核心成員的要求可以說是十分之低。不需要打卡簽到，也沒有一些強制要求，只要做一些任務和抓捕尾獸就可以隨便去做自己想做的事情。

因為曉的這些福利對於大蛇丸來說都是沒有多大用處的。大蛇丸的追求是永生和學會所有的忍術。他加入曉組織可以說就是為了研究佩恩的輪迴眼和鼬的萬花筒寫輪眼。但是大蛇丸剛一出手，就被鼬直接秒掉。一方面大蛇丸的訴求沒法完成，不斷的做任務和收集尾獸是非常影響大蛇丸搞科學研究的。而且有很多科研基地的大蛇丸可是有錢人，而曉組織前期最缺的就是錢；另一方面成名多年的三忍之一卻被自己村子的後輩打敗，這是很丟臉的事情。

而且論勢力的話，大蛇丸是不遜色於曉組織的。曉組織也不過是雨忍村一個總部。但是大蛇丸不但有音忍村作為據點，在各大國都有秘密基地。麾下的人才更是都極為崇拜大蛇丸。別的人可能需要曉組織的勢力來完成一些事情，大蛇丸卻完全不需要。他自己經營多年的秘密基地和蒐羅的人才已經可以堪比五大國的忍村了。像香菱、君麻呂、重吾、水月、紅蓮、音忍五人眾這些手下，都是不遜色於五大國忍村年輕一輩的。如果這些人能夠成長起來，大蛇丸成為音影都是有可能的。

最關鍵的是，大蛇丸雖然硬實力不強，但是他的逃命能力絕對是滿級的。大蛇丸流替身術、不屍轉生、穢土轉生等等這些能力絕對可以讓大蛇丸活到忍者時代終結。不管是叛逃木葉還是叛逃曉組織，大蛇丸都有自信自己能活的好好的。而事實上也確實如此。木葉一直沒能抓到大蛇丸，曉組織的蠍也一直到死也沒有完成抓捕大蛇丸的任務。所以大蛇丸對於曉組織根本是無所謂的。

何況大蛇丸本身的性格也是不相信任何人，以自我為中心的。他為了自己的目的可以拋棄木葉的同伴，又何嘗不能拋棄曉組織呢？在確定了輪迴眼和萬花筒寫輪眼不能到手的情況下，大蛇丸就把目標對準了佐助。但是曉組織初期是以收集金錢為主的，肯定不願意暴露在最強忍村木葉的眼下。因此在曉組織會影響大蛇丸計劃的情況下，大蛇丸自然會毫不猶豫的退出曉組織。而曉組織既不是慈善組織也不是公益組織，怎麼可能讓大蛇丸想來就來，想走就走。先不說大蛇丸走之前襲擊了這種的成員鼬，還在蠍身邊派了間諜兜，單單是大蛇丸辭職的時候沒有把組織的戒指上交就足夠曉組織對付大蛇丸了。離職居然不上交公司物品，這在現代也不行啊！

綜上所述，劍客認為大蛇丸和曉組織的主要矛盾就是曉組織落後的福利無法滿足以自我為中心的大蛇丸的訴求。直接矛盾就是大蛇丸退出曉組織，曉組織卻無力制裁。

大蛇丸和曉的矛盾，可以簡單的理解為是個人主義和團隊意識的矛盾，是追求自我和顧全大局的矛盾。

大蛇丸加入曉，不是為了什麼和平，也不是為了什麼藝術，更不是為了殺人。而是為了自己地研究。大蛇看到了人生的短暫，他追求的是永生，因為即便有了絕對的力量如果不能永生，終究還是要死的。為此，大蛇丸要研究很多稀奇的忍術和血繼界限。

稀奇的忍術，可以在曉的任務中不斷獲得，但是，血繼界限卻很少見。有意思的是，曉裡面就有兩個極為稀有的血繼界限。寫輪眼和輪迴眼。大蛇對這兩樣東西覬覦已久。大蛇丸第一次見到天道，就動手搶，被天道揍了個狗血噴頭。這以後，又瞄準了鼬，又被揍了。這已經碰觸了曉的底線。

曉走的精英路線，每個成員都很精貴。成員之間要互相配合，絕對不可以互相殘殺。大蛇丸搶輪迴眼，這是犯了團隊的大忌。他離開曉是必然。

因為，大蛇滅有妨害到曉。畢竟大蛇追求的是科技。曉追求的是和平。曉裡不允許個性的 存在，但是，沒有了個性，大蛇就不能稱之為大蛇了。曉要求成員必須服從團隊意識，大蛇離開木葉，其中原因之一就是討厭所謂的團隊。