首先，兩者平臺不同。穿越者來自海拉克斯皮卡平臺；而PRADO來自4Runner越野車平臺。雖然兩者都是非承載車身，並且懸架結構也相同，都是前雙叉臂獨立懸架，後四連桿非獨立整體橋，但是避震設定上略有差別，穿越者會偏硬一些，而PRADO則更顯堅韌，懸架舒適度更佳，行駛中底盤表現也更有高階感。
第二大不同，是四驅系統，第二代穿越者，由全時四驅改為了分時四驅。而PRADO，只有中國的中國產版改用了分時四驅，其他地區版本，無論歐版、日版、澳版還是中東版，都繼續採用全時四驅。以可鎖止託森中差為核心的全時四驅，是豐田越野技術的精髓所在，從這個層面講，中東版PRADO的四驅系統，要比穿越者更為高階。
第三大不同，就是車身尺寸，雖然兩者都是七座越野車，但穿越者的三圍尺寸，都比PRADO略小一些，尤其是車身寬度，比PRADO窄了四公分，因此，車內的橫向乘坐空間，也略遜於PRADO，但是，縱向乘坐空間，兩者基本是相同的。跟PRADO和HIGHLANDER一樣，穿越者的第三排也是臨時座椅，只適合短途乘坐。
穿越者和PRADO在動力和耐用性方面還有很多的相同點。動力方面，穿越者所使用的2.7升汽油引擎，跟霸道2700是一樣的，都是豐田的2.7升2TR-FE發動機，最大功率和最大扭矩也相同，都是165馬力，245牛.米。其他方面的共同點也很多，比如兩者的質量可靠性都很高
首先，兩者平臺不同。穿越者來自海拉克斯皮卡平臺；而PRADO來自4Runner越野車平臺。雖然兩者都是非承載車身，並且懸架結構也相同，都是前雙叉臂獨立懸架，後四連桿非獨立整體橋，但是避震設定上略有差別，穿越者會偏硬一些，而PRADO則更顯堅韌，懸架舒適度更佳，行駛中底盤表現也更有高階感。
第二大不同，是四驅系統，第二代穿越者，由全時四驅改為了分時四驅。而PRADO，只有中國的中國產版改用了分時四驅，其他地區版本，無論歐版、日版、澳版還是中東版，都繼續採用全時四驅。以可鎖止託森中差為核心的全時四驅，是豐田越野技術的精髓所在，從這個層面講，中東版PRADO的四驅系統，要比穿越者更為高階。
第三大不同，就是車身尺寸，雖然兩者都是七座越野車，但穿越者的三圍尺寸，都比PRADO略小一些，尤其是車身寬度，比PRADO窄了四公分，因此，車內的橫向乘坐空間，也略遜於PRADO，但是，縱向乘坐空間，兩者基本是相同的。跟PRADO和HIGHLANDER一樣，穿越者的第三排也是臨時座椅，只適合短途乘坐。
穿越者和PRADO在動力和耐用性方面還有很多的相同點。動力方面，穿越者所使用的2.7升汽油引擎，跟霸道2700是一樣的，都是豐田的2.7升2TR-FE發動機，最大功率和最大扭矩也相同，都是165馬力，245牛.米。其他方面的共同點也很多，比如兩者的質量可靠性都很高