透過各種化驗分析的方法，判斷菌株可能具有某種或某些優良性狀。這種方法目前只限用於新菌株選育時作為參照依據，其規律性有的食用菌較明顯，有的還不明顯。可供參考的生理生化指標主要有：
（1）菌絲生長速度 用滅菌後的0.5釐米打孔器將被測菌株的菌絲接種在直徑9釐米的培養皿中間置於23℃條件下培養，每隔24小時測定一次菌落直徑，直至菌絲長滿全培養皿，求平均值。
（2）呼吸強度 採用華勃氏呼吸儀，以單位重量成活菌絲在單位時間內呼吸強度，即透過測定其氧氣消耗量和二氧化碳增長量，判斷菌株呼吸強度與產量的關係。
（3）耐高溫效能 將新接種的試管置於23℃條件下培養5天后，分別置於26℃、28℃、30℃條件下培養，每隔24小時測定一次菌落直徑和觀察菌絲長勢，菌絲生長速度和生長狀態影響小的，耐高溫效能較好。
（4）吃料能力測定 將被測菌株的菌絲接種在裝有發酵糞草料的試管中，置於23℃條件下培養，視其菌種塊萌發速度和向糞草料中伸長情況，以鑑別菌株的生長活力。
（5）纖維素酶和半纖維素酶 蘑菇菌絲相同條件下培養，菌齡相同的菌株這兩種酶活性較高的產量較高。
（6）酯質同工酶 該酶譜測定是菌株優良性狀檢測指標之一，也是同一種類食用菌的不同菌株的鑑別方法之一。透過同工酶譜帶的多少、寬窄、強弱，可以判斷菌株之間遺傳性狀的相似程度和差異程度；同工酶譜與培養基成分、培養溫度、pH、環境條件有關係，可以作為一種綜合性狀的檢測指標。
（7）菌種分子標誌檢測 對於原具有分子標誌的菌株可透過限制性片斷長度多型性（RAPD，RFCP）分析等方法測定，以分析原譜帶有無變化，若有變化，多為變劣的表現。
透過各種化驗分析的方法，判斷菌株可能具有某種或某些優良性狀。這種方法目前只限用於新菌株選育時作為參照依據，其規律性有的食用菌較明顯，有的還不明顯。可供參考的生理生化指標主要有：
（1）菌絲生長速度 用滅菌後的0.5釐米打孔器將被測菌株的菌絲接種在直徑9釐米的培養皿中間置於23℃條件下培養，每隔24小時測定一次菌落直徑，直至菌絲長滿全培養皿，求平均值。
（2）呼吸強度 採用華勃氏呼吸儀，以單位重量成活菌絲在單位時間內呼吸強度，即透過測定其氧氣消耗量和二氧化碳增長量，判斷菌株呼吸強度與產量的關係。
（3）耐高溫效能 將新接種的試管置於23℃條件下培養5天后，分別置於26℃、28℃、30℃條件下培養，每隔24小時測定一次菌落直徑和觀察菌絲長勢，菌絲生長速度和生長狀態影響小的，耐高溫效能較好。
（4）吃料能力測定 將被測菌株的菌絲接種在裝有發酵糞草料的試管中，置於23℃條件下培養，視其菌種塊萌發速度和向糞草料中伸長情況，以鑑別菌株的生長活力。
（5）纖維素酶和半纖維素酶 蘑菇菌絲相同條件下培養，菌齡相同的菌株這兩種酶活性較高的產量較高。
（6）酯質同工酶 該酶譜測定是菌株優良性狀檢測指標之一，也是同一種類食用菌的不同菌株的鑑別方法之一。透過同工酶譜帶的多少、寬窄、強弱，可以判斷菌株之間遺傳性狀的相似程度和差異程度；同工酶譜與培養基成分、培養溫度、pH、環境條件有關係，可以作為一種綜合性狀的檢測指標。
（7）菌種分子標誌檢測 對於原具有分子標誌的菌株可透過限制性片斷長度多型性（RAPD，RFCP）分析等方法測定，以分析原譜帶有無變化，若有變化，多為變劣的表現。