朱元璋推翻元朝時的口號是驅除韃虜、恢復中華，但對於蒙古人，也表示“願為臣民者，與中夏之人撫養無異。”所以明代的蒙古人，只要願意效忠明朝，混得還是不錯的。不像元朝搞了個四等人制度，以蒙古人為第一，色目人第二，漢人、南人在法律地位上遭到各種不平等的待遇。

元朝敗退回到漠北後，中原內地至少還有幾十萬蒙古人。主要是來不及跟元朝皇帝逃走的，特別是南方的蒙古官員和駐軍，大多留了下來，這些人至少有好幾萬，《蒙古源流》一書說，當時“方大亂時，各處轉戰蒙古人等四十萬內惟脫出六萬，其三十四萬俱陷於敵。”

當然，更多的蒙古人進入中原，是在明初的一系列戰爭中被俘的，朱元璋和朱棣時代對蒙古的戰爭規模都很大，被俘的蒙古人數量巨大。如沈兒峪戰役，一次就俘獲了蒙古軍8萬多人，捕魚兒海之戰，更是俘虜了差多9萬人，這些蒙古人有的被安置在南京，有的則被送到邊境當兵和幫明朝養馬。

此外，元朝滅亡後，居住在長城一線的很多蒙古人生活困難，有很多人在首領的帶領下主動投靠了明朝，如火裡火真曾在1381年帶領將校40多人，部眾170多戶主動來投，1405年把都貼木兒、倫都兒灰也率領部眾5000多人來投。

所以，明朝建立後，中原還是有很多蒙古人的。朱元境曾經說過明朝的原則是“不分等類，驗才委任。”不管你是蒙古人也好，漢人也好，只要有能力，都可以當官。明朝的司天監、翰林院裡就有大量的蒙古人，繼續從事相關的外交翻譯、天文觀測等工作。

對於被抓住的蒙古貴族，明朝一般給的待遇都不錯，元惠宗的孫子買的裡八臘被俘後，朱元璋並沒有殺他，而是封他為“崇禮侯”，元代丞相“納哈出”投降後，也被封為海西侯，

至於主動帶人前來歸附的蒙古人，待遇則更好，前面講的火裡火真，被賜漢名“吳允誠”，封同安侯，官至燕中護衛千戶、都督僉事、右副將軍。

明代中期的大學士李賢曾說，明朝各級官員中的蒙古人待遇比漢人還好，同樣品級的官，為了照顧他們，蒙古人的俸祿一般比漢人還要高一些。明朝對蒙古的文人也不歧視，蒙古的文人安童，在朱元璋晚年還當過刑部尚書，咬住當過右副都御史，忽哥赤當過工部侍郎，都是大官了。

明成祖在當燕王時，手下就有不少蒙古文人幫他聯絡蒙古各部，綽羅曾在元朝末年當過兵部尚書，元朝滅亡後，改投朱棣帳下，當了燕王府紀善，後來升任指揮同知、後軍都督僉事，曾經一次性向朱棣了推薦了精通蒙古文的蒙古人七十人，他們後來組成了一個翻譯團隊，專門翻譯明朝發經蒙古各部的詔書和信件。

當然，蒙古的武人在明朝的待遇更好，因為蒙古人善戰，所以明朝在留居中原的蒙古人中會定期徵調他們中的壯丁編成官軍，共有13支部隊，統稱“土達官軍”。明朝中央禁軍的“三大營”中有一個“三千營”，全是蒙古騎兵組成的皇帝專用警衛隊。

在明朝當軍官的蒙古人對明朝的忠誠度也是很高的，把都貼木兒後來被賜漢姓名吳允誠，他的子孫後改姓吳，他的兒子吳克忠、吳克勤，孫子吳瑾後來在土木堡之變中都力戰殉國。火裡火真的孫子“火斌”後來在嘉靖年間的抗倭戰爭中也戰死沙場。

自從秦漢時期開始，中國北方的少數民族，對中原地區的騷擾，愈演愈烈，這是個馬背上的民族，騎乘高質量的馬匹，以以牛羊肉及乳製品等高蛋白食物養大的漢子，作戰無比勇猛，至明朝末年這些少數民族，讓中原的統治者們又恨又怕，對付這些少數民族的武裝，用大兵團進剿，好比用拳頭打跳蚤，他們來如風捲殘雲，退如一陣颶風，中原政權的軍隊，根本無法與這些少數民族的軍隊決戰。

使用小量部隊因為他們作戰，卻時常的被他們吃掉，因此歷朝歷代的君主們，只好以安撫為主，只要他們老老實實的呆在北方的草原上，我就年年得給你些錢財，破財免災。

可這個蒙古族人就不同了，給錢不要，我只要你們臣服，把土地讓出來，作為牧場或者是獵場。

當蒙古人打敗宋朝以後，還真想打算在黃河流域的廣大地區，開設牧場或獵場，最後多虧了一些有識之士相勸，反覆的講明道理，讓漢族人在那裡繼續耕種為主，好讓元朝的統治者取得更大的利益。

蒙古勢力被朱元璋打跑以後，天下的百姓終於的鬆了一口氣，可是散落在全國各地的蒙古族人，有的在農民起義當中被殺掉了，有的隨著蒙古大軍撤離了，但逃走的畢竟是少數，近百萬的蒙古人便留在了全國各地，歸服了明朝的統治，朱元璋也按照歷朝歷代的做法，只要你們不搗亂，就是我大明朝的臣民，與全國其他民族一樣享有同等的待遇，更沒有把它們劃分成有罪的群體，就地贖罪。

也就是說，朱元璋對蒙古人沒有搞株連，相反把這些蒙古族人，安置下來分給田地，由遊牧族改變成耕種的農夫，而這部分人在幾百年的歲月裡，基本上與漢族同化了，就連語言與文字他們都忘記了。

逃到長城以北的蒙古族人，由於失去了中原地區豐富物產的依託，生活極其艱苦貧困，他們渴望與中原地區交往，但又不願意依附於大明朝，而明朝政府又不願意與他們進行貿易往來，想在物資上困死他們，一些受不了的蒙古人開始嚮明朝投誠，並得到優厚的待遇。

萬般無奈下，蒙古人只好發動戰爭，迫使明朝政府開放貿易區，在當時的張家口，大同，呼和浩特等一些地區，都有蒙漢互市的集市。