專款專用的資金不可以與專案資金混用。財政專項資金使用與監督管理辦法所謂專項資金，是國家或有關部門或上級部門下撥的具有專門指定用途或特殊用途的資金。這種資金都會要求進行單獨核算，專款專用，不能挪作他用。

在當前各種制度和規定中，專項資金有著不同的名稱，如專項支出、專案支出、專款等，並且在包括的具體內容上也有一定的差別。但從總體看，其含義又是基本一致的。

資金用途：

（1）用於投資補助和獎勵投資補助，是指政府部門對符合條件的企業投資專案和下一級地方政府投資專案給予的投資資金補助，一般政府給與的投資補助不高於總投資額度的30%。獎勵，是政府部門對錶現突出，業績優秀，具有重大創新貢獻企業的一種鼓勵政策，獎勵額度視具體情況而定。

（2）用於貸款貼息和轉貸貼息，是指政府部門對符合條件、使用了中長期銀行貸款的投資專案給予的貸款利息貼息。支出性質從支出性質分類，專項資金包括個人部分（如：專項補貼、專項獎勵等）和公用部分（如：專項購置、專項修繕等）；支出用途從支出用途分類，可以將專項資金分為基本建設支出、專項業務費、專項支出購置、專項修繕和其他專項等。

在財政部印發的《中央本級專案支出預算管理辦法》中規定，專案支出預算是在基本支出預算之外編制的年度專案支出計劃（或專項資金支出計劃）。專案按照其性質可以分為基本建設類專案、行政事業類專案和其他類專案。對於地方而言，專項資金分類與中央專案支出分類基本一致，只是在資金來源和使用方面存在一些差別。