P-ATA+S-ATA：並行和序列硬碟並存模式，此時SATA和PATA通道都相互獨立互不干擾，理論上4個P-ATA和2個S-ATA可同時接6個裝置，實際上得根據不同主機板而定，有的南橋晶片就只支援4個ATA裝置。此時SATA1口硬碟對應Third IDE Master(第三IDE通道主盤)，SATA2口硬碟對應Fourth IDE Master(第四IDE通道主盤)。
S-ATA：序列硬碟增強模式，此時理論上支援4個序列硬碟，但還得看主機板的支援情況(如果是ICH5R晶片組如P4P800，想組RAID模式，則必須要選擇此項，並將Configure S-ATA as RAID項設為Yes，S-ATA BOOTROM項設為Enable，設定後BIOS自動檢測的時候按“Ctrl+I”進行RAID設定)。
讓SATA和PATA和平共處的關鍵在於其佔用的IDE通道位置不能衝突。還要注意，DOS/Win98/WinMe系統只能支援4個IDE裝置，而Win2000/XP/2003系統可支援6個裝置（注：第三方的SATA控制器可突破此限制）。關於SATA佔用IDE通道位置的設定部分，各廠家有所不同。
以Intel 865PE晶片組的ICH5南橋為例：
進入BIOS後，選擇Main下的IDE Configuration Menu，在Onboard IDE Operate Mode下面可以選擇兩種IDE*作模式：
相容模式和增強模式（Compatible Mode和Enhanced Mode）。
其中Compatible Mode，可以理解為把SATA硬碟埠對映到並口IDE通道的相應埠，通常適用於DOS/Win98/WinMe系統；
Enhanced Mode下的SATA硬碟將使用獨立的IDE通道，不與原PATA裝置衝突，但僅適用於Win2000/XP/2003系統。
一、BIOS設定部分
由於各家主機板的BIOS不盡相同，但是設定原理都是基本一致的，在此只介紹幾種比較典型的BIOS設定，相信讀者都能夠根據自己主機板BIOS的實際情況參考本文解決問題。
1.南橋為ICH5/ICH5R的主機板
先以華碩的P4C800為例，這款主機板晶片組為i865PE，南橋為ICH5/ICH5R。進到BIOS後，選擇Main下的IDE Configuration Menu，在Onboard IDE Operate Mode下面可以選擇兩種IDE*作模式：相容模式和增強模式(Compatible Mode和Enhanced Mode)。其中相容模式Compatible Mode，可以理解為把SATA硬碟埠對映到並口IDE通道的相應埠，當你選擇這種模式時在下面的IDE Port Settings中會有三個選項：
Primary P-ATA+S-ATA：並行IDE硬碟佔據IDE0+1的主通道(Primary IDE Channel)，序列SATA硬碟佔據IDE2+3的從通道(Secondary IDE Channel)。也就是說這時主機板上的第二個並行IDE介面對應的埠不可用。
Secondary P-ATA+S-ATA：與上面正相反，此時主機板第一個並行IDE介面(Primary P-ATA)上對應的埠不可用，因為給SATA硬碟佔用了。
P-ATA Ports Only：遮蔽了序列SATA硬碟介面，只能使用並行介面裝置。
注：前兩種模式中，主機板上的SATA1介面自動對應IDE通道中*主盤位置，SATA2介面自動對應IDE通道中*從盤位置。
當選擇模式為增強模式Enhanced Mode時，其下的埠設定的字樣變為Enhanced Mode Supports On，其中也有三個選項：
P-ATA+S-ATA：並行和序列硬碟並存模式，此時SATA和PATA通道都相互獨立互不干擾，理論上4個P-ATA和2個S-ATA可同時接6個裝置，實際上得根據不同主機板而定，有的南橋晶片就只支援4個ATA裝置。此時SATA1口硬碟對應Third IDE Master(第三IDE通道主盤)，SATA2口硬碟對應Fourth IDE Master(第四IDE通道主盤)。
S-ATA：序列硬碟增強模式，此時理論上支援4個序列硬碟，但還得看主機板的支援情況(如果是ICH5R晶片組如P4P800，想組RAID模式，則必須要選擇此項，並將Configure S-ATA as RAID項設為Yes，S-ATA BOOTROM項設為Enable，設定後BIOS自動檢測的時候按“Ctrl+I”進行RAID設定)。
P-ATA：其實還是一種對映模式，SATA硬碟佔據的是第一個IDE通道，SATA1口對應第一個通道的主盤，SATA2口對應第一個通道的從盤。
當你使用的是Win98/Win NT/Win2000/MS-DOS等傳統的*作系統時，由於它們只支援4個IDE裝置，所以請選擇相容模式Compatible Mode，並根據你的實際硬碟數量和位置選擇IDE Port Settings中*對應選項；當你使用的是WinXP/Win2003等新型的*作系統時，可以選擇增強模式Enhanced Mode來支援更多的裝置。當然如果你安裝Win98+Win XP雙系統的話，也只好選擇Compatible Mode了。另外，有的主機板BIOS有BUG，致使在單個SATA硬碟上安裝Windows 98SE系統時不能正確安裝SATA硬碟(如：華擎P4VT8)，只需要升級BIOS版本到最新版就可以解決了。
注：雖然SATA硬碟本身並沒有主從之分，但是如果使用了埠對映的模式，當你想要並行硬碟和序列硬碟共存時，還是得注意硬碟所佔的位置不要衝突了，而且啟動順序也需要在BIOS中根據實際情況進行相應調整