首先，李世民採用的手段是暗殺，秦瓊也不可能24小時保護。假設真有秦瓊保護，房杜肯定會給李世民謀劃一個秦瓊不在時的暗殺計劃。而且太子身邊護衛不少，李世民選擇了太子進宮見皇帝，防衛鬆懈的時候動手，太子也沒想到被人在皇宮門口殺了。

其次，被動防守，百密難免一疏，從太子的角度，最好的辦法是先下手為強，當然這是按照結果反推的，當時估計太子沒認識到問題的嚴重性。

最後，唯一能制止骨肉相殘的是皇帝李淵。作為帝王，有一個優秀的兒子是很幸福的事，可有兩個很優秀的兒子就是個大麻煩。一個兒子居中排程，一個兒子帶兵征戰，都為大唐帝國立下大功。李淵因為李建成被立為太子，早期想過給李世民更多的優待，開府（天策將軍府）甚至打算讓李世民鎮守洛陽，負責國家東部事務。後面發生的事以及大臣們的提醒，讓李淵明白，這樣做會使二人的矛盾更加尖銳，李淵死後，大唐肯定分裂。到後期，李淵明顯開始對李世民進行壓制，比如不讓房杜接近李世民，禁止李世民結交豪傑等等。有句話：願生生世世不在帝王家。太子之爭是你死我活的，李淵當時必須狠下心來，犧牲一個兒子，當然不是殺掉，最好把其中一個安排到偏遠地區，反應正就是讓一個徹底沒了機會。李淵想兩個兒子都好，但當時已經不可能了。萬幸當時絕大多數大臣都置身事外，哥倆誰當皇帝都可以，即使發生了政變，國家也沒有大亂。

所以說，玄武門之變不是一個秦瓊，程咬金或是尉遲恭能夠阻止了的！

如果李淵讓秦瓊站在太子一邊，李世民和尉遲敬德聯手，也未必殺得了建成元吉。綜合史料來看，李淵是把李建成當做政治家來培養的，所以一直把太子留在身邊幫助自己處理政務，只有當李世民實在擺不平劉黑闥的時候，太子建成才親自出馬，李建成一出馬就用攻心計打贏了，這才讓秦王李世民感到了威脅。因為是當做政治家培養，所以李淵並沒有把當時的頂尖悍將秦瓊程咬金等人配屬給李建成，只有個瓦崗舊部魏徵幫著出謀劃策，但不管魏徵多麼足智多謀，真動起手來還得靠秦瓊那樣身經百戰威望極高的悍將，魏徵什麼都算計到了，就是沒算計到自己這些人馬根本就打不過李世民集團的尉遲恭程咬金。　　

如果李淵把秦瓊派去保護李建成，那麼李建成在玄武門之變中有幾分勝算？按照新舊唐書等正史記載，秦瓊似乎有一種任何人都難以抗拒的人格魅力：目空一切的大隋驍將來護兒，誰都瞧不起，但偏偏對秦瓊格外禮遇；齊郡通守張須陀仗著老鄉關係招攬了秦瓊，也是讓他建牙開府當了正六品的建節尉（有人說是建衙而不是建牙，那是不懂古代官制，建牙，指的是樹立自己的牙旗，有了完全歸自己指揮的部隊）；秦瓊投奔瓦崗，李密做夢都會笑醒：“密得叔寶大喜，以為帳內驃騎，待之甚厚”；王世充得到秦瓊，也是馬上加封龍驤大將軍。可以說無論是英雄來護兒張須陀還是梟雄李密王世充，都難以抗拒秦瓊的人格魅力，李淵更是恨不得把自己身上肉割下來給秦瓊吃。　　

　　秦瓊在瓦崗軍的時候，最驕傲的單雄信開懷暢飲之後手舞足蹈：“咱們現在天下無敵了，因為秦叔Bora了！”言下之意就是“放眼天下，我可能就打不過秦瓊”而軍人世家出身（沒賣過私鹽，善使馬槊而不是大斧）的程咬金，更是隻聽秦瓊一個人的話。如果秦瓊歸屬太子建成，程咬金就不會給李世民出主意了，如果太子建成手下有魏徵出謀劃策，程咬金當機立斷，再加上秦瓊的悍勇無敵威名赫赫，那麼尉遲敬德寧肯回家打鐵，也不肯在玄武門跟秦瓊對陣——被秦瓊打得心裡有陰影。　　

　　但是李淵一招失措，致使太子建成滿盤皆輸。李世民之所以在玄武門之變中笑到了最後，實際是軍事家打敗了政治家，刀把子打贏了筆桿子，而其中最大的變數就是秦瓊秦叔寶，李淵如果用好了秦瓊，或者讓秦瓊獨立帶兵，或者讓秦瓊歸屬太子建成，那麼也就不會發生一天之內兩個兒子十個親孫子被殺的慘劇了——李世民毫不客氣地一股腦砍了李建成的五個兒子（安陸王承道、河東王承德、武安王承訓、汝南王承明、鉅鹿王承義）和李元吉的五個兒子（梁郡王承業、漁陽王承鸞、普安王承獎、江夏王承裕、義陽王承度）……

如果李淵讓秦瓊站在太子一邊，那也改變不了最終結果。

首先，李世民發起的玄武門之變所使用的是擒王之術。李建成和李元吉低估了李世民，只帶了幾個隨從進入玄武門。即使秦瓊是太子的部下戰將，他們的目的是去父王面前告狀，也沒有必要帶秦瓊進入玄武門。

其次，太子李建成和李元吉，自認為皇宮戒備森嚴，且玄武門城門守將常何是自己人，進入玄武門萬一有變，常何自會相助於他們，擒下拿李世民。但是他們萬萬沒想到常何一直是李世民的人，不到沒有幫到他們反而關閉城門防止他們二人逃跑。

第三，李世民預謀在先，已經先行控制了玄武門，控制了李淵，拿下李建成和元吉做好了充分的準備。

因此，李建成和元吉在玄武門死在李世民手裡與秦瓊是誰的人已經沒有關係。

小說看多了吧，以為秦瓊是戰神啊，宣武門之變，秦都沒參加的，他選擇了誰都不幫。所以說秦只忠於李源，後期全身病也沒什麼作為了

你預設的立場就是錯誤的，你首先認定秦瓊肯定對李淵唯命是從李淵讓他幹什麼他就幹什麼。這才是最大的錯誤，秦王集團是跳脫於皇權之外的獨立的先朝廷是以秦王為核心的利益集團他們只聽命於李世民如果秦王有令要殺皇帝那秦瓊也會二話不說提刀就上。有人總喜歡把秦瓊算李淵的人無關乎就是如果我的肉可以吃就割下來給你吃這條記載然而秦瓊對這些話卻是無動於衷既沒有感激流涕也沒有感恩戴德就很說明問題了。