進行過海戰，但相較於大西洋和太平洋，蘇德海戰規模很小，這主要是因為蘇軍的海軍力量比較弱且地理環境不好。蘇聯海軍在二次世界大戰中大部分的任務是部隊運輸和破交作戰。在各海域主要還是以潛艇和魚雷艇為主力，海軍航空兵部隊也發揮了積極的作用。

二戰時，事實上，德國海軍從未和蘇聯海軍有過面對面的正式交鋒，德國空軍的戰鬥機和轟炸機都曾有過和蘇聯海軍水面作戰艦艇的交戰紀錄，包括德國陸軍有用150毫米大口徑榴彈炮炮擊過蘇聯海軍水面作戰艦艇的情況。

1941年10月31日，曼施坦因率領第11集團軍發起了塞瓦斯托波爾戰役，利用大量150毫米重型榴彈炮，對塞瓦斯托波爾外圍的諸多要塞陣地陸地包括對蘇聯海軍黑海艦隊的水面艦艇發動了猛烈攻擊。

德國空軍也用戰鬥機和轟炸機，對黑海艦隊的水面艦艇發起了空中打擊，導致黑海艦隊大部分水兵上岸，參與了陸地戰爭，成了二戰時的奇葩兵種。

為儲存海軍實力，不做無畏的犧牲，多數水面艦艇不得不撤出，前往高加索地區待機，只留1艘戰列艦和2巡洋艦組成火力支援隊，支援陸上防禦作戰，對控制黑海海域，保障海上交通暢通無阻，作出了重要的貢獻。

此外，在1941年6月，巴巴羅薩計劃實施以前，蘇聯最大的波羅的海艦隊，就已被德軍水雷封鎖，泊在軍港動彈不了了，里加、塔林、立耶帕亞等重要海軍基地喪失，主要基地列寧格勒出海口被芬蘭軍隊封鎖，所以處境非常糟糕。

北方艦隊除了執行支援陸軍作戰和破壞德國海上交通線等任務之外，還擔負著在白海和巴倫支海的護航，它總共護送盟國運輸隊船隻約1500艘、本國運輸隊船隻2500多艘。

但據蘇聯自身統計，二戰期間，波羅的海艦隊潛艇破交戰，擊沉了德國300萬噸商船，擊沉了一艘繳獲荷蘭的巡洋艦。