(Open Reading Frame, ORF) 開放閱讀框是DNA上的一段鹼基序列,由於擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段鹼基序列產生合適大小蛋白才出現的終止密碼子,該段鹼基序列編碼一個蛋白。
一般我們拿到一個序列會在NCBI上進行ORF find
就是檢視該序列可能的閱讀框和編碼的氨基酸序列
我們一般根據序列在ncbi上比對的結果和ORF查詢的結果來確定基因的閱讀框
一般真核生物沒有多順反子,即一個mRNA編碼一個基因。
在原核細胞中,通常是幾種不同的mRNA連在一起,相互之間由一段短的不編碼蛋白質的間隔序列所隔開,這種mRNA叫做多順反子mRNA。這樣的一條mRNA鏈含有指導合成幾種蛋白質的資訊。
順反子的概念來自遺傳學中的順反重組試驗,是確定交換片段究竟在一個基因內還是屬於兩個基因的試驗,簡言之,一個順反子就是一個基因,多順反子就是多個基因。真核生物中也有多順反子,比如C.elegans共有13500個基因,約25%的是多順反子(polycistronicmRNA)。
多順反子見於原核生物意指一個mRNA分子編碼多個多肽鏈。這些多肽鏈對應的DNA片斷則位於同一轉錄單位內,享用同一對起點和終點
(Open Reading Frame, ORF) 開放閱讀框是DNA上的一段鹼基序列,由於擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段鹼基序列產生合適大小蛋白才出現的終止密碼子,該段鹼基序列編碼一個蛋白。
一般我們拿到一個序列會在NCBI上進行ORF find
就是檢視該序列可能的閱讀框和編碼的氨基酸序列
我們一般根據序列在ncbi上比對的結果和ORF查詢的結果來確定基因的閱讀框
一般真核生物沒有多順反子,即一個mRNA編碼一個基因。
在原核細胞中,通常是幾種不同的mRNA連在一起,相互之間由一段短的不編碼蛋白質的間隔序列所隔開,這種mRNA叫做多順反子mRNA。這樣的一條mRNA鏈含有指導合成幾種蛋白質的資訊。
順反子的概念來自遺傳學中的順反重組試驗,是確定交換片段究竟在一個基因內還是屬於兩個基因的試驗,簡言之,一個順反子就是一個基因,多順反子就是多個基因。真核生物中也有多順反子,比如C.elegans共有13500個基因,約25%的是多順反子(polycistronicmRNA)。
多順反子見於原核生物意指一個mRNA分子編碼多個多肽鏈。這些多肽鏈對應的DNA片斷則位於同一轉錄單位內,享用同一對起點和終點