建議還是分了好，近親結婚主要考慮是繁育後代方面的，近親結婚，基因相近的情況下，生下來孩子容易出現基因突變和基因缺陷的情況。所以不提倡近親結婚和談戀愛。你要不考慮以後和下一代，那就沒辦法了。

媽媽的堂妹，也就是說你媽的那一代對於你媽來說是直系血親。但是她是你媽媽的堂妹的兒子，那就是對於你女兒來說，這種關係那就是屬於三代以內的旁系血親。中國婚姻法明確規定，禁止近親結婚。在辦結婚證的時候辦理人員會給個本子你看，本子上面介紹著的婚姻法條例上面清楚地寫著，禁止直系血親和三代以內的旁系血親結婚。如果結婚是屬違法行為的。作為家長要認真對待此事，阻止他們繼續交往發展下去。如果處理不當會引起很嚴重的後果。年輕人一時衝動情有可原，不要用凌厲的責罵手段。作為家長要正確有耐心的指導教育子女，詳細的跟子女細說近親結婚的利害關係。

近親結婚的危害性很大，後果很嚴重。近親結婚會引起長輩的隱性病史成為子孫後代的顯性疾病。兩個人近親結婚會大大提升後代的隱性疾病得病機率。近親結婚生育的後代患上隱性遺傳病的機率也明顯更高。這就是為什麼近親結婚生育的子女，比非近親結婚生育的子女患上隱性遺傳病的可能性要大的多的緣故。

近親結婚所生育的後代所患的疾病大都是比較惡劣的不治之症。如白血病、智力低下、先天性畸形、多基因遺傳病等。

媽媽堂妹的女兒，也就是共同祖先應該是你媽的祖父，往下數到你這裡是第三代，屬於三代以內旁系血親，依法是不許結婚的。