藥店可以開發票，只是一般你不要求開，他們不會主動開，每個藥店都有額度的，超開稅額就高了；另外是嫌開票麻煩，尤其是個體藥店，如果藥店自身沒申請金稅控，就需要店主帶著資料去稅務局開！

一般來說，藥店肯定不會主動給顧客開發票，但買藥時如果要求藥店開發票，藥店就有義務開，藥店不給開發票的原因可能有以下幾個:

1、開票金額太小，藥店怕浪費發票。一般的藥店發票都是千元版的，但買藥的大都是個人，所以金額只有幾十元，頂多幾百元，所以藥店覺得金額太小，不願意給開，這時您可以與藥店協商，如幾個月開一次票，或者消費夠一定金額再統一開發票；

2、藥店從稅務局領的發票是有限量要求的，而買藥的人很多，所以藥店儘量只為重要顧客和消費金額大的顧客開發票，無法滿足所有購藥者的開票需求；

3、可能有偷漏稅的嫌疑。年收入達到500萬要從小規模納稅人升級為一般納稅人，稅率從3%升到16%，儘管有進賬發票的抵扣，但大家都知道，進賬票也不是很容易取得的，所以一旦升級為一般納稅人，藥店的稅負肯定會增加，為避免升級，藥店可能會隱瞞一部分收入，而開了發票的收入是無法隱瞞的，所以藥店儘量會少開發票。另外，即使不面臨升級一般納稅人的問題，藥店也可能會為隱瞞收入少交稅而不開發票。當然藥店這樣做會有稅務風險。

4、還有一點可能也不能排除，因為藥是特殊商品，需要相關部門的批准才可以製造和出售，如果藥店進的藥有問題，他肯定不會給你開發票，因為發票會成為法律證據。所以建議大家儘量去正規大藥店去買藥。

第一，是麻煩，現在都是普票或者專票，另外一個系統出發票，不是收銀機直接打出來的，所以很麻煩。第二，發票數量有限，有些人幾塊十塊都要求開，哪有那麼多。第三，要交稅，開多了，就要交稅了