孟森對明代制度評價頗高，認為明代各種制度奠定了明代二百多年的國祚，至明中後期，只因偏離了制度，所以才最終導致滅亡，而清朝入關以後，基本上沿襲了明代制度，所以清代亦有二百多年國祚，幾與明代相始終。誠然，孟森的結論應也有所誇大，但事實上，清初，清朝各項制度基本沿襲明代，科舉制度亦是如此。清代不同明代，明初科舉制度曾有過短暫廢停，清代入關伊始，即明確開科考試。清順治元年（1644），順治帝下《即位詔》，其中明確規定:

會試定於辰、戌、醜、未年，各直省鄉試定於子、午、卯、酉年。凡舉人不繫行止黜革者仍準會試，各處府州縣儒學食廩生員仍準給廩，增附生員仍準在學肆業，俱照例優免。武舉會試定於辰、戌、醜、未年，各直省武鄉試定於子、午、卯、酉年，俱照舊例。京衛武學官生遇子、午、卯、酉鄉試年仍準開科，一體會試。（《清世祖實錄》卷九）

即所有舉人，只要沒有被黜革，都可以正常參加會試，所有府州縣儒學生員，廩生“仍準給廩”，增生、附生仍可按照正常學制畢業，並且同樣享有優免（明代生員除本身免役外，還可以額外免家中兩人），武舉鄉會試亦同。由此，可以看出清初是認同明代的生員的，所以生員一樣可以正常參加鄉試，且同明代一樣享有免役待遇。不但生員，舉人亦可參加會試。順治二年，清廷即舉行鄉試，順治三年，又接著舉行會試，兩次鄉會試，有許多生員、舉人參與。