日本幕府是日本古代的一種政府機構，最高權力者成為幕府將軍，掌握實權。幕府制度的時間大致是從1185--1867，經歷三個時代，分別是鎌倉幕府，室町幕府，江戶幕府。

鎌倉幕府由武士源賴朝建立，以將軍為核心，實行獨裁統治，架空了天皇。1199年源賴朝死後，外戚掌控幕府。1232年，北條氏公佈了《貞永式目》，後來成為日本的全國性法律。後來由於貧富差距拉大，社會矛盾尖銳，鎌倉幕府被足利尊氏推翻，由天皇親政。

鎌倉幕府被推翻後，足利尊氏覺得沒有獲得期望的利益，於是起兵攻陷了京都，立光明天皇為傀儡，在京都開設幕府。第三代將軍足利義滿在京都的室町建成幕府作為新址。這就是室町幕府，這時的幕府權力核心掌握在大名手裡，將軍的力量被削弱。到了足利義政時期，國內矛盾大爆發，室町幕府進入戰國時代。

後來織田信長的勢力壯大，擊敗了其他割據勢力，滅掉了武田信玄等名將。織田信長死後，豐臣秀吉統一了日本，但是並沒有開設幕府，他死後，德川家康於1603年在江戶開設幕府，這就是江戶幕府。江戶幕府的核心依然是大名，大名實際上是各個藩國的統治者，具有很強的獨立性。

由於外國勢力入侵，加強內部矛盾逐漸激化，最後由德川慶喜將權力交給天皇，後來由明治天皇徹底打敗幕府，結束了幕府的統治，進行了明治維新，日本從此進入近代社會。

日本歷史上的幕府與中國史上的幕府涵義完全不同，是所謂“武家政權”的代名詞。武士、富士山和櫻花是日本的三大象徵。武士階層出現於日本平安時代中後期，是隨著王權衰落、盜賊橫行及豪強兼併的社會現象而產生。尤其在天皇政府連續發動的旨在征服蝦夷部落的戰爭中，大批的武士立有戰功，逐漸取得了相應的社會地位，當武士集團與一些野心貴族相結合，其對政權的染指已是箭在弦上了。

在日本史上，曾先後出現過五個武家政權，其中有三個其首領取得了“徵夷大將軍”稱號，即被後世史家稱之為幕府政權。

按照存在的時間順序，名稱分別為鎌倉幕府、室町幕府和江戶幕府，（不包括之前的平家和戰國時期的織豐政權）。由於篇幅所限，這裡分別簡要介紹如下：

鎌倉幕府是由於同有天皇血脈的平氏集團與源氏集團的爭權鬥爭的激化，而最終以內戰的形式予以解決。。。。至1185年三月的壇浦之戰以源氏大獲全勝而告終，源賴朝的關東武士集團得以成立了以鎌倉為中心的實權政府。由於源賴朝生前為鞏固自身獨裁，除掉了源氏族內多位實力派人物，包括其兩個弟弟。因此，他死後，幕府大權逐漸被外戚北條氏掌握，在1221年承久之亂後，為緩和矛盾，北條氏承諾與15名強大武士家族共同執政。鎌倉幕府後期，因社會矛盾激化，尤其是因抗元戰爭立功的大批中小武士沒有得到賞賜，而公然加入到幕府的敵對派中。到1324年後醍醐天皇舉兵倒幕時，鎌倉幕府遂迅速垮臺。

室町幕府是在日本歷史上的南北朝混戰中得以產生，其始祖足利尊氏是推翻鎌倉幕府的最大功臣之一，然在勝利後沒有得到後醍醐天皇的重用，於1335年起兵反叛，第二年攻佔京都，另立天皇，自任將軍，室町幕府誕生。但由於後醍醐天皇南逃吉野，在新田義貞、楠木正成等武士首領擁戴下，自稱正統，日本歷史上南北朝時代由是而來。多年征伐後，室町幕府逐漸取得優勢，到第三代將軍足利義滿時代基本統一全國，但由於多年戰爭，使得各地方大名割據勢力猖獗，室町幕府不過是其聯盟的首領而已。

地方大名間的大規模內戰在室町幕府晚期爆發，日本進入所謂戰國時代。眾多的梟雄在全日本崛起，其中尾張的織田氏及其部將豐臣秀吉在戰爭中壯大，逐漸掌握全國政權。到1598年豐臣秀吉猝死後，權力秩序再次混亂，德川家康最終奪取政權，於1603年被認命為徵夷大將軍，在江戶設立幕府，日本歷史上最後一個幕府政權——德川氏的江戶幕府就此誕生。

始於1185年終於1867年德川幕府的德川慶喜還政於天皇，幕府政治結束，共682年。其間經歷鎌倉幕府、室町幕府、德川幕府三個階段，室町幕府和德川幕府之間有一段時間沒有幕府，地方上的武士諸侯大名紛紛混戰，被稱為戰國時代。