首先要確定是否是真的蛋白尿。因為血液(月經等)、尿道口周圍膿液或陰道分泌物汙染尿液時，常規尿蛋白定性檢查時均可呈陽性反應，這時詳細詢問病史、進行必要的檢查予以排除。

其次要判定蛋白尿的性質，是功能性蛋白尿還是病理性蛋白尿。功能性蛋白尿有一定的原因，如發熱、受凍、劇烈運動、高溫作業、應激狀態以及高度的尿液濃縮等；體位性蛋白尿與體位改變有關；這兩者都為暫時性的，原因去除後蛋白尿可消失。若蛋白尿為持續性的，則應視為病理性，應積極尋找產生蛋白尿的疾病。

最後要確定產生蛋白尿的原因和疾病，常見原因包括腎小球性蛋白尿、腎小管性蛋白尿、溢位性蛋白尿、分泌性蛋白尿、組織性蛋白尿。如輕中度蛋白尿伴有血尿、水腫、高血壓等，多為腎炎綜合徵；如大量蛋白尿伴有明顯水腫、低蛋白血癥、高脂血症等，多見於腎病綜合徵；如為輕度蛋白尿伴夜尿增多、蛋白尿以小分子為主，多為腎小管間質疾病；如尿常規檢查尿蛋白不多，24小時尿蛋白定量尿蛋白較多(兩者不成比例)，尤其是血或尿中單克隆輕鏈增高，考慮多發性骨髓瘤所致的溢位性蛋白尿；如伴有尿路刺激症狀，尿沉渣中白細胞增多，尿培養有致病菌，則見於腎孟腎炎或腎結核等感染性疾病；總之要結合病史、臨床特徵及各項實驗室檢查作出及時、正確的診斷。