中國政策規定，醫藥企業之間發生業務往來時，必須有首營資料交換，而且要根據目錄要求的資料一一提供，缺一不可。

但是，由於紙質首營資料交換具有交換時間長、成本高、儲存不便、容易造假等弊端，越來越多企業選擇首營電子資料交換。

1、檔案載體：首營紙質資料交換用的是紙質載體，耗費大量的樹木、硒鼓等資源；首營電子資料交換以電子為載體，綠色環保無汙染。

2、簽章方式：首營紙質資料交換採用實體印章，容易出現假章多、無法發現資料篡改的情況；首營電子資料交換採用電子印章，無假章，立即發現資料篡改。

3、儲存方式：首營紙質資料交換透過紙質、檔案櫃、儲存室等方式進行資料儲存；首營電子資料交換採用計算機儲存。

4、查驗方法：首營紙質資料交換需要人工稽核，難辨真偽，安全隱患很大；首營電子資料交換採用實名電子認證，杜絕隱患。

5、操作步驟：首營紙質資料交換要一個一個部門稽核，蓋章，猶如一場公關戰；首營電子資料交換則是線上協同，網路同步。

6、各項費用：首營紙質資料交換需要用到紙張、影印、檔案袋、櫃子、儲存室、快遞、人力等費用；首營電子資料交換僅需電腦和網路就可以了。

7、法律效力：合法、合規的首營電子資料交換與首營紙質資料交換具備同等法律效力。

8、交換時長：首營紙質資料交換需要3至20天；首營電子資料交換僅需要幾分鐘。

9、交換方式：首營紙質資料透過物流快遞、人員攜帶，首營電子資料交換透過網路傳遞。

10、監管方式：首營紙質交換透過現場檢查，首營電子資料交換透過網路檢查。

11、成本對比：首營紙質交換效率低，成本高。首營電子交換效率高，為醫藥生產、流通企業、藥店和醫療機構節省成本。

12、到期提醒：首營紙質交換沒有提醒功能，很容易錯過更新資料的時間而導致業務受阻。但是，首營電子資料交換則有更新提醒功能，可自主設定到期更新時間。

傳統首營資料的稽核採用人工錄入和稽核的方式，資料流通採用快遞的方式，耗時長，人工、郵寄成本大，程式複雜，而首營資料電子交換平臺流通只需要到平臺上註冊並上傳相關資料，上游或下游企業進行搜尋選中，就可以一鍵交換所需資料了，資料交換稽核完畢，即可進行交易。