摩爾根的果蠅雜交實驗初次證明基因在染色體上，運用了假說演繹法。
1910年5月在摩爾根的實驗室中誕生了一隻白眼雄果蠅。他把這隻果蠅與另一隻紅眼雌果蠅進行交配，在下一代果蠅中產生了全是紅眼的果蠅，一共是1240只。這些F1代紅眼的果蠅產生的後代中紅眼和白眼數量之比為3:1，實驗中F1全為紅眼，說明紅眼對白眼為顯性，而F2中紅眼和白眼數量之比為3:1，符合遺傳分離規律，表明果蠅的紅眼和白眼由一對等位基因來控制。所不同的是白眼性狀總與性別相關聯。摩爾根認為，既然果蠅的眼色遺傳與性別相關聯，說明控制紅眼和白眼的基因在性染色體上。後來摩爾根讓一隻白眼雌果蠅與一隻正常的雄果蠅交配。卻在其後代中得到雄果蠅全部是白眼，而雌果蠅中卻沒有白眼，全部雌性都長有正常的紅眼睛。摩爾根假設控制白眼性狀的隱性基因由X染色體所攜帶，Y染色體上不帶有白眼基因的等位基因。摩爾根用這個假設合理的解釋了他所得到的實驗現象，後來透過測交實驗進行了驗證。
摩爾根及其同事、學生用果蠅做實驗材料。到1925年已經發現它有四對染色體，並鑑定了約100個不同的基因。並且由交配試驗而確定鏈鎖的程度，可以用來測量染色體上基因間的距離。1911年他提出了染色體遺傳理論。摩爾根發現，代表生物遺傳秘密的基因的確存在於生殖細胞的染色體上。
染色體可以自由組合，而排在一條染色體上的基因是不能自由組合的。摩爾根把這種特點稱為基因的連鎖。由於同源染色體的斷離與結合而產生了基因的自由組合。不過交換的情況很少，只佔1%。連鎖和交換定律是摩爾根發現的遺傳第三定律。他於20世紀20年代創立了著名的基因學說，揭示了基因是組成染色體的遺傳單位，它能控制遺傳性狀的發育，也是突變、重組、交換的基本單位。
摩爾根的果蠅雜交實驗初次證明基因在染色體上，運用了假說演繹法。
1910年5月在摩爾根的實驗室中誕生了一隻白眼雄果蠅。他把這隻果蠅與另一隻紅眼雌果蠅進行交配，在下一代果蠅中產生了全是紅眼的果蠅，一共是1240只。這些F1代紅眼的果蠅產生的後代中紅眼和白眼數量之比為3:1，實驗中F1全為紅眼，說明紅眼對白眼為顯性，而F2中紅眼和白眼數量之比為3:1，符合遺傳分離規律，表明果蠅的紅眼和白眼由一對等位基因來控制。所不同的是白眼性狀總與性別相關聯。摩爾根認為，既然果蠅的眼色遺傳與性別相關聯，說明控制紅眼和白眼的基因在性染色體上。後來摩爾根讓一隻白眼雌果蠅與一隻正常的雄果蠅交配。卻在其後代中得到雄果蠅全部是白眼，而雌果蠅中卻沒有白眼，全部雌性都長有正常的紅眼睛。摩爾根假設控制白眼性狀的隱性基因由X染色體所攜帶，Y染色體上不帶有白眼基因的等位基因。摩爾根用這個假設合理的解釋了他所得到的實驗現象，後來透過測交實驗進行了驗證。
摩爾根及其同事、學生用果蠅做實驗材料。到1925年已經發現它有四對染色體，並鑑定了約100個不同的基因。並且由交配試驗而確定鏈鎖的程度，可以用來測量染色體上基因間的距離。1911年他提出了染色體遺傳理論。摩爾根發現，代表生物遺傳秘密的基因的確存在於生殖細胞的染色體上。
染色體可以自由組合，而排在一條染色體上的基因是不能自由組合的。摩爾根把這種特點稱為基因的連鎖。由於同源染色體的斷離與結合而產生了基因的自由組合。不過交換的情況很少，只佔1%。連鎖和交換定律是摩爾根發現的遺傳第三定律。他於20世紀20年代創立了著名的基因學說，揭示了基因是組成染色體的遺傳單位，它能控制遺傳性狀的發育，也是突變、重組、交換的基本單位。