在全球變暖和人類干擾活動的共同作用下，海洋生態系統呈現出生物多樣性喪失，食物網變化，漁業資源衰竭等危機，不但降低了海洋自我調節能力，而且降低了為人類社會提供服務的潛力。海洋生態保護與人類社會發展兩者統一起來，不要過度捕撈，不要汙染和粗放開採。

相關辦法①借鑑國外生物多樣性立法經驗，結合中國國情，完善法律環境，依法管理。②統一取樣方法，提高資料可比性，建立一套有效的開放共享體系。③進行中小尺度的評估，尤其加強對重要生態系統和脆弱生態系統的探索。④實現隨監測資料更新對模型的及時調整，即加強評估模型的靈活性，提高評估可信度。⑤加強學科交叉，從不同領域研究海洋生物多樣性，多角度認識海洋生態系統，用多種形式展示生態系統的演變規律，科學評價海洋，合理保護海洋，最終實現海洋的可持續發展。

具體開展科學技術的研究內容（1）透過建立和發展區域、全球的監測和觀測網路系統，開展全球變化海洋生態學的聯網觀測與試驗，全面提升中國近海生態系統觀測與深海大洋的探測能力，全面、深入瞭解海洋生態系統多樣性及其變化規律；（2）加強影響海洋生態系統結構及其變化的關鍵物理過程（海洋鋒面、躍層、中尺度渦等）、 海洋生態系統的能量流動和物質迴圈研究，促進中國海洋生態系統基礎研究水平的提升；（3）更多地從生態系統的角度開展海洋生物多樣性研究，且在較大時空尺度和在較長的時間階段對海洋生物多樣性變化與生態系統結構與功能、生物多樣性與氣候變化、生物多樣性模式進行研究； （4）加強海洋漁業活動對海洋生態系統影響的研究。 魚類作為海洋生態系統的重要 組成部分,它的捕獲不僅是減少了其種群數 量,也改變了海洋生態系統的結構,這種改變反過來又可能會影響該魚類種群。 強烈的海洋漁業活動可能造成海洋生物種類的系列性枯竭； （5）利用合成生物技術、空間資訊科技等，促成一系列前沿的海洋生物多樣性研究和保護取得進一步的重大突破；（6）加強海洋生態系統評估與最佳化管理研究，建立、健全海洋生物多樣性保護措施 的長效性機制，找到更好的保護和可持續地 管理海洋生態系統與生物多樣性的有效解決方式；（7）加強海洋生態系統的恢復機理與技術研究，在逐步拓展以生態恢復、環境修復和海洋生物多樣性保護為目標的科學研究與實踐活動的同時，更加關注全球變化對生物多樣性的綜合影響、海洋環境與全球變化的相互作用等；透過典型區域生態系統退化治理，為海洋生態脆弱區域生態系統功能的恢復與重建提供科學依據；（8）積極參與海洋生態系統與生物多樣性科學領域的國際合作，促進研究合作與成 果的交流，進一步推進中國海洋生態系統多樣性研究與保護的健康發展。