摩托車發動機都是鋁製外殼，散熱很快，馬達也是外接的，而且啟動馬達和機殼只是兩顆螺絲連線，熱量到啟動馬達已經沒什麼溫度了。內部是靠一個壓力飛輪連線的（原理和腳踏車的飛輪一樣，只不過腳踏車是單向齒，摩托車是壓力珠）基本和曲軸不是硬連線，所以光靠機油傳遞，也傳遞不了太多熱量。

摩托車發動機在行駛中，溫度很高，為什麼不會燒壞發電機？發電機內結構耐熱絕緣材料，線材採用高強度漆包線，另一方面設計時發電機不會直接靠近發動機，不會達到發電機燃燒點，對高強度線材鐵芯周邊有80度左右，也不見得會燒燬。但有一可能發電機超載執行或短路，難保發電機會燒燬。供參考。

啟動馬達和發動機溫度沒啥關係，啟動馬達只有在發動機啟動的瞬間 工作幾秒鐘，發動機啟動後 啟動馬達自動復位 停止工作，所以即使發動機高溫不不可能燒壞啟動馬達

題主說的應該是使用風冷發動機的摩托車吧，這種摩托車行駛中發動機溫度雖然高但是不至於把起動機燒壞。

首先我們要說一說電機是怎樣燒壞的。電動機裡面有線圈，電流透過線圈時產生磁場，在磁力作用下轉動。而線圈是用漆包線繞成的，漆包線就是外表塗了絕緣漆的導線。這樣可以保證電流線上圈中按繞線方向流動從而產生需要的磁場。

電機工作時電流透過線圈產生磁場，磁力相斥產生動力。電能就轉換為動能。如果電動機負載太大會導致轉速下降甚至轉不動。這時候電能無法完全轉化成動能，於是一部分電能就轉化成線圈的熱能。如果電機完全轉不動的話電能基本上全部轉化成線圈的熱能了，這時候線圈就相當於一根電熱絲，那發熱量非常厲害，基本上幾秒鐘時間就能燒壞漆包線外面的絕緣漆，絕緣漆燒壞後線圈就會短路，這時候線圈相當於白熾燈的燈絲，瞬間熔斷。一般起動機漆包線耐熱溫度為180度左右，也就是說你能把線圈加熱到180度才有可能破壞漆包線使線圈短路燒壞電機。

而摩托車發動機很難把起動機線圈加熱到這麼高的溫度。上圖是一臺摩托車發動機，汽缸體和氣缸蓋的溫度是最高的。因為氣缸內部在進行燃燒，而氣缸蓋上有排氣門，排氣門裡流動的是高溫尾氣。其實汽缸體本身溫度並不見得非常高，因為混合氣燃燒過程很快，傳熱時間有限。而且進氣衝程吸入氣缸的低溫空氣和汽油汽化都有降溫作用。而氣缸蓋由於不斷經受著高溫尾氣的炙烤反而溫度可能更高。起動機則安裝在曲軸箱上面，曲軸箱的溫度主要來自中缸熱傳導，再加上曲軸箱體積很大，散熱能力好，所以曲軸箱溫度並不會特別高。而曲軸箱的溫度還是以熱傳導的方式傳遞給起動機，起動機線圈與起動機外殼之間又不是直接接觸的，所以說摩托車行駛中起動機線圈實際溫度遠遠低於漆包線的耐受溫度，也就不可能燒壞了。