野生中藥材和種植的差別非常大，種植藥材主要有三大問題：

1、種源的逐代退化問題。

以靈芝為例，靈芝在人工種植馴化過程中，種源會逐代退化，野生靈芝的種源是自然界優勝劣汰的結果，所以野生靈芝的氣味、形狀和藥效都會比較穩定。而種植靈芝因為人工育種，失去自然匹配最佳化過程，所以首先在形狀、氣味和質地上就會有明顯差異，外觀上一代比一代規整，質地越來越輕，不使用營養素的話就會越來越小，氣味也越來越淡。至於藥效更是差之千里。

2、生長環境的改變導致藥效減弱問題。

中藥材是講究四氣五味的，這個四氣五味從哪裡來，其生長的環境起了決定性作用。野生中藥材的環境是自然選擇的結果，屬於生物學中的最優解。生長過程中充分吸收了自然環境的“氣”和“味”，也就是特定環境的能量與資訊。而種植藥材則完全沒有這種環境，藥效就遠遠跟不上了。這一點其實不止中藥材，包括其他農林作物，如水果蔬菜等，甚至禽畜也是一樣道理。如果有人非要說飼料雞鴨就是比土雞土鴨好吃，貧道除了對其的重口味表示無限敬仰之外，更多是無語。

有差別，野生中藥材不上化肥，不打藥。人工種植的中藥材，為了經濟利益。去上化肥又打藥。還有一個關鍵點。中藥材。在生長的過程中，為了有更好的療效。是講年限的。有些中藥材需要三年才能達到療效。人工種植的一年就開挖了，藥效也大大降低，達不到治病效果。