高爾基體的主要功能將內質網合成的蛋白質進行加工、 對比分類、與包裝，然後分門別類地送到細胞特定的部位或分泌到細胞外。 　　高爾基體是完成細胞分泌物最後加工和包裝的場所。從內質網送來的小泡與高爾基體膜融合，將內含物送入高爾基體腔中，在那裡新合成的蛋白質肽鏈繼續完成修飾和包裝。高爾基體還合成一些分泌到胞外的多糖和修飾細胞膜的材料。細胞中蛋白質的合成從細胞核中的基因組DNA轉錄合成信使RNA（mRNA）開始，mRNA穿過了細胞核到達核外，在內質網（ER）上合成了蛋白質，此時蛋白質會從內質網上以小囊泡的形式脫離下來，其目的地就是物流中心----高爾基體，就像工廠裡面生產出來的商品被輸送到物流中心再向使用者配送一樣。其實，被輸送到高爾基體的蛋白質上面已經標記了蛋白質的去向，就像商品進入物流中心時都會貼好收貨人地址一樣。此時，高爾基體就會讀取蛋白質的“收貨地址”，如果這個蛋白質上有“分泌”訊號，高爾基體就知道這個蛋白質需要被分泌到細胞外，於是就形成一個可以分泌蛋白質到細胞外的小囊泡，把需要分泌到細胞外的蛋白質包裹到裡面並最終分泌到細胞外。如果蛋白上有訊號表示該蛋白質應該留在內質網，高爾基體就會形成另外一種小囊泡，把蛋白送回到ER。高爾基體就是這樣透過閱讀蛋白質上的資訊把蛋白運送到“收貨人”手中。高爾基體物流中心的功能還不止是這些，它還會對運輸的貨物----蛋白質進行加工，這個加工過程就是把各種寡糖鏈連線到蛋白上，這個過程稱為糖基化，而這種糖基化是蛋白最終可以執行各種功能的保證。