可以抵扣3%，另外注意下，現在小規模也可以自開增值稅專用發票了，但這樣的有隱患，還是稅務局代開的安全，相當於有稅務局的背書

小規模納稅人開具的增值稅專用發票，一般納稅人是可以抵扣的，並且是按照專用發票上面註明的稅率來抵扣的，一般是3%或者5%。

小規模納稅人可以透過以下兩種方式來開具增值稅專用發票：

1、屬於以下八個試點行業的小規模納稅人，可以使用稅控裝置自行開具專用發票，即“自開專票”：住宿業，鑑證諮詢業，建築業，工業，資訊傳輸、軟體和資訊科技服務業，租賃和商務服務業，科學研究和技術服務業，居民服務、修理和其他服務業。自開專票的特點是“先開票、後繳稅”，即這八個試點行業的小規模納稅人平時可以先開專用發票無須預繳增值稅，然後在規定的納稅申報期內（小規模納稅人現在大部分都是按季度申報）就開具專用發票的銷售額計算增值稅應納稅額，並向主管稅務局申報繳納增值稅。

2、不屬於上述八個試點行業的小規模納稅人只能向主管稅務局申請代開專用發票，即“代開專票”。代開專票的特點是“先繳稅、後取票”。小規模納稅人代開專票，既可以攜帶相關資料（營業執照、公章、業務合同和取票人身份證件等）到稅務局現場申請、預繳稅款、領取專票，也可以選擇在電子稅務局上面提交申請，等稽核透過之後，再攜帶取票人身份證件到辦稅大廳視窗或者自助取票機上預繳稅款、領取專票。

需要注意的是，從稅務局代開的增值稅專用發票，發票票面上會註明“代開”字樣，而且發票下方的銷售方是主管稅務局的資訊，代開企業的名稱和稅號會在備註欄裡註明。

按照增值稅對稅款抵扣憑證的規定，增值值稅專用發票是最常見和最重要的稅款抵扣憑證。

由於國家對增值稅專用發票，實行了全國聯網、全面採集發票資訊並進行資訊交叉比對等各種管理手段，對增值稅專用發票的管理實行全環節、全鏈條的管理，因此，對於增值稅專用發票抵扣來講，只要是能夠透過交叉比對，而且業務真實的，就不會區分開票方的納稅人資格，而直接根據增值稅專用發票上註明的增值稅稅額，從銷項稅額中進行抵扣。

關於增值稅專用發票代開的業務，稅務總局明確規定，增值稅專用發票代開業務，稅務機關不能委託給其他組織和個人，必須由稅務機關進行代開，因此，從工作流程角度來講，小規模納稅人代開的專用發票都是從稅務局來代開的，它的真實性是絕對不容置疑的。

因此小規模納稅人代開的專用發票，是完全可以用於抵扣的。