1、定義不同

綜合性高中：綜合高中是一種為學生提供升學為主、就業為輔的教學模式，培養既有紮實的文化基礎知識，又達到一定的專業技能標準的綜合性人才。

普通高中：普通高中即普通高階中學，屬於高階中等教育學校的範疇，用以區別中師、中專、職高、技校等學校，普通高中是中國高階中等教育的主體，是高階中等教育的基本組成部分，是中國九年義務教育結束以後更高等的教育機構，上承初中，下啟大學，學制一般為三年。

2、作用不同

綜合性高中：其主要特點是按專業大類招生，文化課採用普高教材，允許一年或兩年後分流到職業中專，學生實習在寒暑假完成。

學生在學校組織下可參加省普通高中或綜合高中會考，成績合格者發給普通高中或綜合高中會考證書，畢業生可報考高等職業院校或普通高校，也可由畢業學校擇優推薦，雙向選擇，自主就業。

普通高中：普通高中教育是在九年義務教育基礎之上進一步提高國民素質、面向大眾的基礎教育。是大眾性和基礎性的非義務性教育，普通高中是中等教育的後期或高階階段，相容按層次分的“中等教育”與按類別分的“普通教育”兩重性質。

是使學生進入高等教育學校或社會的過渡階段，是基礎性教育，是面向大眾的教育，是終身教育的重要組成部分。