(一)治療

嚴重銅綠假單胞菌屬感染的治療應採用敏感藥物聯合治療，劑量與療程決定於感染部位與感染嚴重程度，若是慢性感染或有病灶處解剖結構的破壞，療程常需數週乃至數月。目前，作用較強的抗菌藥物有半合成青黴素，如阿洛西林和哌拉西林，其中以哌拉西林為最常用。第三代頭孢菌素中以頭孢他啶、頭孢哌酮的作用較強。其他β內醯胺類藥物中亞胺培南及氨曲南;氨基糖苷類如慶大黴素、妥布黴素、阿米卡星和異帕米星;氟喹酮類如氧氟沙星、環丙沙星及氟羅沙星等都有一定作用。在藥敏結果未獲得前，可選用(表1)推薦的方案。

近年來，銅綠假單胞菌對常用抗生素的耐藥率有明顯上升，這在重症監護室(ICU)和肺纖維化的患者中尤為嚴重。有資料顯示ICU中銅綠假單胞菌對亞安培南的耐藥率已從早年的12.9%上升至18.5%(1999年)，而對氟喹諾酮類的耐藥率更是高達23%。故一旦細菌培養陽性，應即進行藥敏測定，以供選藥時參考。外科的清創、深部膿腫的引流對控制本屬細菌感染十分重要;瓣膜置換術後的發生的銅綠假單胞菌心內膜炎，亦應積極創造條件再進行瓣膜置換術，不能單一依靠抗菌治療而坐失手術時機。此外，也有作者提出可採用高效銅綠假單胞菌抗血清或高效多價人血丙種球蛋白(丙種球蛋白)治療銅綠假單胞菌感染，惟療效仍不確切，故不作常規推薦。

(二)預後

繼發於敗血症者病情危重，病死率極高，中樞神經系統感染預後較差，病死率在60%以上。