清除幽門螺桿菌是治療幽門螺桿菌引起的慢性胃炎、胃潰瘍、十二指腸潰瘍、胃息肉等疾病的重要措施。對於合併有以上疾病的幽門螺桿菌陽性患者，幽門螺桿菌被清除後最直觀的判斷方法是反酸、消化不良、上腹部不適、疼痛等症狀緩解，飲食及健康狀況逐漸恢復正常。

但要想準確知道幽門螺桿菌是否被徹底清除與否，比較靠譜的辦法是三聯或四聯療法結束一月後，進行碳13或碳14呼氣尿素酶檢查。也可以透過複查胃鏡，進行活檢染色、胃液尿素測定或細菌培養進行檢查，準確性比呼氣實驗高，但由於呼氣檢查是無創檢查，而且檢查方法比較簡單方便。

另外還有一種方法是抽血化驗檢查幽門螺桿菌抗體，但由於幽門螺桿菌清除後很長時間內人體血液內仍然有抗體存在，所以準確性不是很高，一般較少應用。

現在已經明確幽門螺桿菌感染是一種感染性疾病。它是引起慢性胃炎，消化道潰瘍，甚至胃癌的一個重要因素。所以對於檢測出幽門螺桿菌感染，一般有症狀的都需要進行根除治療。目前根除幽門螺桿菌，採用的是四聯療法即質子泵抑制劑和兩種抗生素以及鉍劑聯合。通常來說這種治療需要兩週時間，但是在治療後是否已經根除徹底需要檢測。一般在治療一個月後需檢測。

幽門螺桿菌檢測，最常用的是非侵入性的檢測方法，包括尿素呼氣試驗以及糞便抗原試驗，血清學實驗。尿素呼氣實驗是最常用最簡便的方法，一般採用的是碳14尿素呼氣試驗或者碳13尿素呼氣試驗。它的檢測準確率相對還是比較高的，而且不受幽門螺桿菌在胃內的分佈影響。

但是當這個檢測值接近臨界值的時候，結果可能就不可靠，為了提高它的檢測準確性，可以在隔一段時間後再次檢測。對於胃部分切除術後的患者，使用尿素呼氣檢測方法準確性會顯著下降。糞便抗原試驗檢測，可以在一些配合欠佳的情況下選擇，比如兒童對於呼氣檢測實驗配合不好。

如果患者有需要做胃鏡檢查胃部情況的話，也可以採用胃鏡活檢，採用尿素酶試驗作為幽門螺桿菌的檢測。但是在幽門螺桿菌根除治療後，幽門螺桿菌的密度會顯著降低，在胃內的分佈也會發生改變，所以這種活檢可能效果並不好。所以胃鏡活檢，最好用於，需要知道是否感染了幽門螺桿菌的檢測而不是檢驗根除治療的效果。