一般情況下用海棠種子會穩定一些，優勢更多。

在蘋果育苗中常用海棠作砧木。然而由於海棠種子價格較高，蘋果種子便宜，為了節約成本，有相當一部分農民用果汁廠的下腳料蘋果種子育苗。

蘋果樹是砧木嫁接品種接穗成苗結果的樹種，因為蘋果種子做砧木育苗，嫁接蘋果品種屬“共砧”，會有好有壞，壞的表現為根系不發達，抗病、抗旱、抗寒、抗逆性差，蘋果樹壽命短、產量低、質量差。

為了讓廣大果農正確辨認海棠砧木和蘋果種子砧木，根據專家多年的經驗，總結出以下六點區別供果農參考。

一是種子區別

　　海棠種子個頭較小，微黃。蘋果種子個頭較大，微紅。

　　二是根系區別

　　海棠種子生出的根系細小的鬚根拐彎多、不順直，側根細並無明顯皺褶且光滑，根皮薄，毛根多，根較軟。蘋果種子生出的根系鬚根較直，側根粗並有明顯的皺褶，根皮厚，毛根少，根較硬。

　　三是根莖區別

　　海棠苗根莖處青綠色，蘋果苗根莖處灰綠色。

　　四是枝條區別

　　海棠砧木枝條表皮白色的星點小而稀，蘋果砧木枝條表皮白色星點大而密。

　　五是發芽時間區別

　　海棠砧木發芽早，蘋果種子砧木發芽晚。

　　六是生長勢區別

　　海棠砧木當年幼苗期生長慢，後期特別是第二年以後生長快；蘋果砧木當年幼苗期生長快，後期特別是第二年以後生長明顯比海棠砧木慢。

最多兩週， 如果種子沒有反映的話就放棄，如果種子膨大鑽出根系就移種到沙土中 ，但樹苗發出芽再移載到通氣良好的腐殖土中， 加入一定的黃泥比例 ，放到光照通風好的地方就可以了。

正常蘋果苗一年後應該都是嫁接的，一般用一年的海棠根嫁接品種，因為海棠根發達而易成活相對來說抗病蟲害綜合防治能力強！

海棠果樹和蘋果樹，可從葉片和果實區分。兩者葉片外形基本相似，蘋果樹的葉片邊緣帶有圓鈍鋸齒，葉片為草質狀，海棠果樹葉片為厚革質。