你好題主，這個問題很有趣！

二者都是他們各自時代最著名的醫學大師，根據時代和社會不斷進步的理論在醫學上也是根據時代而進步的，扁鵲是戰國時代人，在華佗前，而華佗為東漢末年時代人，在時代上來說扁鵲掌握的藥理華佗也會，而華佗掌握的藥理扁鵲不一定能掌握。所以從時代的角度來說本人覺得華佗更勝一籌。

扁鵲（公元前407—前310年）嬴姓，秦氏，名越人，又號盧醫，春秋戰國時期名醫。華佗（約145—208）字元化，沛國譙（今安徽亳州市譙城區）人，東漢末醫學家。一個春秋戰華人一個是東漢末年，這個問題如同關公戰秦瓊。

扁鵲，春秋戰國時期名醫！他周遊列國到各地行醫，為百姓治病！由於扁鵲的醫術高明，為百姓治療了許多疾病，所以百姓送他扁鵲的稱號！在許多文獻中也記載了他的生平事蹟！所以應該能肯定歷史上是真實存在的！

華佗，東漢末年著名的醫學家！他和扁鵲差不多平生到處行醫！他和董奉、張仲景稱為建安三神醫！在許多文獻中也評價過華佗的醫術高明！所以根據文獻記載華佗應該實有其人！

我認為兩者的醫術不好比較！因為兩人所處的年代不同，兩者所擅長的科目不同不能很好的比較！如果非要比較的話我認為應該是華佗醫術應該會好一些！時代在不斷的發展和進步，扁鵲和華佗年代相差有幾百年，在後期的華佗醫學界的水平肯定有所提升！就好比現在我們的醫療水平與七八十年代有著巨大的變化！所以後期應該是越來越精通，更能夠解決疑難雜症！但兩者對醫學界的貢獻我認為扁鵲的貢獻會更大一些，他為傳統的醫學診斷法奠定了基礎！（個人觀點歡迎評論補充）