在同一種內對種群（父群和母群）的挑選。無論透過什麼途徑育種，都離不開種群的選擇，種群的好壞直接關係到子代蜂群的優劣。這一工作，是蜜蜂育種的基礎，主要透過對蜂群的經濟性狀、生產力、形態特徵等方面鑑定考察來選代完成。

蜂群的經濟性狀 指那些與蜂群生產力有著密切關係的生物學特性。它是由蜂王和工蜂共同體現出來的。

經濟性狀是多方面的，歸納起來，可分為產育力、群勢增長率、分蜂性、採集力、抗病性以及抗逆性等方面。

蜂群生產力 指某蜂種或蜂群生產蜂產品的能力，它是蜂群經濟性狀的綜合結果。蜜蜂育種工作的最終目的，就是要選育生產力強的蜂種，以適應養蜂生產的需要。

生產力可用蜂蜜、王漿、花粉、蜂蠟、蜂膠等各項蜂產品的年產量來衡量。

蜂群的形態特徵 蜜蜂的每一品種、品系除了具有特定的經濟性狀外，還具有特定的外部形態特徵，根據這些外部形態特徵可將各品種、品系區別開來，同時也可判定一群蜂的純雜。無論蜂種資源調查還是原種儲存，提純復壯，純種選育和雜交育種都要用到形態特徵鑑定。

中國蜜蜂育種工作者在對蜜蜂進行形態鑑定時，通常只測定三型蜂的體色，工蜂噱長、第三腹節背板長度、第四腹節背板絨毛頻寬度、第五腹節背板覆毛長度、前翅的長和寬、肘脈指數。

選種工作中除了對上述內容進行考察外，還有一些與蜂群管理關係密切的性狀需要考察，這些性狀分別是蜂群溫馴性、清巢習性、防衛效能、定向性、盜性、採膠習性、造贅脾習性和蜜房封蓋型別等