有性繁殖園藝植物選擇育種的一般程式：優良單株選擇——株系比較選擇——品種預備實驗——品種比較實驗——生產試驗和區域實驗。

有性繁殖園藝植物選擇育種的基本選擇法有混合選擇法和單株選擇法。

混合選擇法：從一個原始混雜群體中選取符合育種目標的優良單株，混合留種，次年播種與同一塊圃地，與標準品種及原始群體小區相鄰種植，進行比較鑑定的選擇法。對原始群體的混合選擇只進行一次，當選擇有效時就繁殖推廣的，稱為一次混合選擇法。對原始群體進行多次混合選擇後再繁殖推廣的，稱為多次混合選擇法。

混合選擇法的優點：

簡便易行，省時省力。不需要很多土地、勞力及專設的實驗圃地就能迅速地從混雜群體中分離出優良型別，在較短時間內能獲得較多的繁殖材料，便於及早推廣。對混雜嚴重的農家品種也可提純良種。混合選擇時不同單株間可以自由授粉，可以保持豐富的遺傳特性，故不會造成生活力衰退。

混合選擇法的缺點：

混繁不能鑑別每一個體基因型的優劣，這就使由於環境條件優越而性狀表現突出的單株選留下來，但其基因型並非優良，從而降低了選擇效果。

單株選擇法：從原始群體中選取優良單株分別編號，分別留種，次年單株種植成一單株小區，根據各植株的表現進行比較鑑定的選擇法。若只進行一次單株選擇，以後就以各株係為取捨單位，稱為一次單株選擇。

單株選擇法的優點：

可以對所選優株的基因型進行鑑定，消除環境飾變引起的誤差，提高選擇效率。

單株選擇法的缺點：

A.費工費時。需專門設立圃地，異花授粉作物需要隔離。

B.異花授粉作物多次隔離授粉易引起生活力衰退。

C.選擇一次留種量有限，選出優系後難以迅速應用於生產。

加速選種的主要方法。提前進行生產試驗與多點試驗；利用保護地進行一年多代繁殖選擇；異地栽培加速繁殖；加速繁殖和提高種子繁殖係數。