紫外線消毒工藝具有其他消毒工藝所無法比擬的優勢，克服了現有傳統消毒技術的缺點。歐洲許多國家以及北美的加拿大和美國已在九十年代分別修改了環境立法，在廢水處理後的消毒，以及飲用水的消毒上，推薦了採用紫外線消毒技術。紫外線消毒的優勢主要表現在： （1）、紫外線消毒技術具有較高的殺菌效率，執行安全可靠。紫外線消毒僅需幾秒鐘即可達到同樣的滅活效果，且由於不投加化學藥劑，不會對水體和周圍環境產生二次汙染； （2）、對隱孢子蟲和賈第蟲有特效消毒效果，常規的氯消毒工藝對隱孢子蟲和賈第蟲的滅活效果很低，並且在較高的氯投加量下會產生大量的消毒副產物兒紫外線消毒在較低的紫外線劑量下對隱孢子蟲和賈第蟲就可以達到較高的滅活效果； （3）、不產生有毒有害產物，由於不投加化學藥劑，不會產生對人體有害的副產物； （4）、能降低臭味和降低微量有機物； （5）、佔地面積小，執行維護簡單、費用低； （6）消毒效果受水溫、PH影響小。 紫外線效果技術在工程應用中也存在一定的缺點，主要有以下幾個方面： a、無持續殺菌能力，消毒後的水如果遇到新的汙染源，會再次被汙染，需與氯配合使用； b、濁度及水中懸浮物對紫外線殺菌有較大影響，降低消毒效果；

c、紫外燈套管容易結垢，影響紫外光的透出和殺菌效果，因此需要對套管進行定期的清洗以及採取表面降溫措施來防止管垢的形成； d、細菌的復活現象。一些細菌被紫外線照射失活的病毒細菌可透過光的協助修復自身被破壞的組織，達到復活目的，另外一些細菌可能存在著暗復活現象（無需光照）； e、國內使用經驗少，對於紫外線消毒的應用也還存在較多問題。