首先扁桃體和甲狀腺不是一種器官

扁桃體是位於口咽部咽顎弓和舌顎弓之間的扁桃體隱窩內的一對腺體，其作用主要是免疫防禦。

甲狀腺是位於氣管前的一個蝶形腺體，其作用主要是分泌甲狀腺激素，起內分泌調控作用。

扁桃體結石主要是由於扁桃體長期處於阻塞，分泌物引流不暢，導致乾酪樣物積聚，致不易溶解的鈣、鎂等無機鹽沉積而成結石。

而甲狀腺結節是由於多種原因（如甲狀腺退行性變、炎症、自身免疫以及新生物等）形成的甲狀腺內結節樣病變，甲狀腺結節也可以合併鈣化。

臨床上對於影響生活質量的扁桃體結石，主要透過手術操作取出，手術創傷小，風險低，預後良好。

而甲狀腺結節則需要綜合綜合考慮甲狀腺結節的影像學表現、甲狀腺功能及細針穿刺的結果，通常簇狀微鈣化是惡性甲狀腺結節的一個重要超聲表現，但並不是所有的鈣化都提示結節惡性，這需要交由臨床醫生綜合判斷。對於惡性或嚴重影響生活治療的甲狀腺結節應儘早手術，而對於惡性程度較低的甲狀腺結節亦可採取臨床觀察。