性格原因。

關羽傲王侯而體恤士卒。張飛尊士者蔑小人。

關羽出身底層，對士兵很好，對士大夫有天生的牴觸情緒。張飛出身世家，尊重有能力的知識分子，對小人（底層百姓）非常嚴厲。

諸葛亮也是世家子弟，無論先天條件，還是後天環境，都會喜歡張飛而疏遠關羽。

首先，個人覺得，題主所提的這個問題，似乎不太成立。

有網友認為，據正史記載，張飛的兩個女兒，後來成了劉備的皇后了，因此諸葛亮多親近（巴結）張飛；另又有文友指出，關羽之所以兵敗麥城，被擒殺害，是劉備與諸葛亮，厚此（張飛）薄彼（關羽），繼而見死不救，借刀殺人的……

個人認為，上述的觀點，都有失偏頗和公允，請看下列的原因分析：

一，據正史記載，關羽在“水淹七軍”之後，接著著手進攻襄樊樊城，這一大謀劃，是得到了劉備與諸葛亮等，決策層的首肯的。其時，劉備正在成都，籌備登基稱帝。而關羽就想著攻取了樊城，把它作為，敬獻劉備登基稱帝的“開胃大禮包”。

二，據《三國演義》原著小說描述，諸葛亮初出茅廬的時候，關羽和張飛，對諸葛亮都表示不太信服。後來諸葛亮施巧計，“火燒博望坡”，關張二人才信服的。

三，在《三國演義》原著小說裡，最初，劉備是攜同“鳳雛”龐統，去攻取西川的。而諸葛亮與關羽，則留守荊州。如果諸葛亮與關羽，關係不融洽，或者說諸葛亮駕馭不了關羽的話，劉備集團，還會作這樣的安排嗎？！

如果真要挑出，諸葛亮喜愛張飛，而多疏遠關羽的話，那也是身為蜀國丞相的諸葛亮，在玩“權力制衡”的遊戲而已！