第一，條理性。《周易本義》在“周易”內容編排上可謂是匠心獨運。通常認為《周易》是指上經下經加“十翼”，而《周易本義》則啟發性地把“河圖洛書”、“卦圖卦歌”和“筮儀”等內容，恰到好處地排在裡面，顯得很有條理性，也豐富了《周易》的發展脈絡。

第二，前瞻性。《周易本義》在“周易序”末句談到“已形已見者可以知言，未形未見者不可以名求，則所謂易者果何如哉？此學者所當知也”，這句話給易學向著伏羲方向追溯留下了嫋嫋餘音。

最後，錯誤之處。《周易本義》對易經整體架構的把握是比較精準的，但也存在著錯誤之處。例如，對《河圖》《洛書》的形狀和含義不加區分，以及對伏羲卦圖的來歷不加區分。早期的陰爻用“∧”表示，簡單以破折號“——”表示應是後期的事情。當然這是因為朱熹先生也許見不到甲骨文字等早期文字材料，我們也不要苛求古人。今天有更多的考古材料可以參考，我們應明辨之，剖析之。以利於還原古代文獻的本義。

章太炎：，，是漢人雖說《河圖》，《洛水》，卻未言河，書為何象。宋人說《易》，創為河，洛及先天八卦圖。朱晦庵《易本義》亦列此圖。其實先天圖書荒唐悠謬，要當以左道視之，等之天師一流可矣。

《周易本義》有‘‘四妄’’：一是畫蛇添足式地‘‘妄加’’，在傳統《周易》中，加入河圖洛書……一組既沒有歷史傳承，也沒有得到認定的數字圖案;二是毫無邏輯式的‘‘妄變’’，此卦變彼卦，毫無根據，徒增複雜;三是脫離大義地‘‘妄斷’’，武斷地認定《易經》為占筮之書，失《易經》言大道之哲學大義;四是不求甚解地‘‘妄定’’，在《周易本義》中，有許多解釋不得要領，或在邏輯上講不通，朱熹皆以‘‘其佔如此’’來確定其解釋，讓讀者莫名所以。

朱熹《易本義》肯定《易經》是占筮之書，沒錯。因為《易經》卦辭爻辭盡是占筮吉凶之辭，蒙卦卦辭，初筮告，明確無誤，就是占筮。託名孔子《易傳》就已經肯定《易經》是占筮：是故君子居則觀其象玩其辭，動則觀其變而玩其佔。是以自天佑之，吉無不利。

問題在於，作為儒家的朱熹，竟然採納了道家之說。道教為爭《易》的話語權，否定了周文王與孔子，只承認伏義的《易》，即先天八卦。河圖，洛書，先天八卦圖，都是道教所作，而朱熹都納入自己的書中。對此，章太炎有言：

是漢人雖說《河圖》《洛書》，卻未言圖，書為何象。宋人說《易》，創為河，洛及先天八卦圖。朱晦庵《易本義》亦列此圖，其實先天圖書荒唐悠謬，要當以左道視之，等之天師一流可矣。