第一種情況,房子實際用於經營,並且房產證上房屋用途為商用。這種情況的商鋪沒有任何爭議，具體補償專案及計算方式如下：

1、房屋價值的補償：根據國務院590號令規定，有兩種補償方式：純貨幣補償，可參考周邊同地段商鋪的價格爭取；產權置換，可按照房子實際面積去爭取同地段最低拆一平還一平。

2、停產停業損失的補償。需要結合房子實際經營年限、營業收入綜合停業限期等因素確定。具體有以下幾種計算方法：

①由評估機構評估來定。

②按照生產經營效益等指標，結合相關的公式確定。例如北京市：停產停業損失補償費=(用於生產經營的非住宅房屋的月租金+月淨利潤×修正係數+員工月生活補助)×停產停業補償期限。

④按照經營面積計算。例如濟南市：一次性停產停業損失補償費按被徵收非住宅房屋建築面積計算，營業、生產用房為每平方米200元，其他非住宅用房為每平方米150元。

3、搬遷費及過渡費用補償。

搬遷費可以根據實際需要估算確定；過渡費用可結合具體過渡期限和每月租房費用確定。

第二種情況，房子實際用於經營，但是房產證上是住宅，就是通常所稱的“住改非”。這種情況和真正的商鋪還是有一定區別的。

實踐中，這種情況，房屋價值的補償不能直接按照商鋪去爭取，但實踐中可以參考住宅和商鋪之間的價格爭取。其他補償專案比如停產停業損失、搬遷費和過渡費可直接按照上述第一種情況中去主張。