在一個偏僻的抄鄉村裡，有襲一個十四歲的男孩，名叫尼爾斯。他的父母勤勞善良，但是尼爾斯卻不愛學習，專做惡作劇，欺負小動物。

在一個初春裡，他的父母去教堂了。他因為在家裡欺負一個小精靈，被小精靈變成了一個拇指大小的小人兒。

就在這個時候，有一群大雁從空中飛過。院子裡的雄鵝莫頓想要飛上天空與大雁們一起飛行。尼爾斯擔心雄鵝飛走，父母會傷心。就緊緊地抱住雄鵝的脖子。卻沒想到，尼爾斯竟被帶上了高空，隨著一群大雁走南闖北。

在空中的旅途中，尼爾斯見到了許多有趣的事情、美麗的風景，也幫助過許許多多人和小動物。尼爾斯逐漸改正了缺點，懂得了學習和進步，養成了優秀的品德。

最終，尼爾斯告別了大雁，回到家中，解除了魔法，變回了人類。

這時候，一群大雁飛了過來，是阿卡的雁群！

尼爾斯朝他們跑過去，但是雁群受到了驚嚇，呼地一下全飛走了。

尼爾斯明白了，他們並不知道自己就是大拇指。

儘管尼爾斯很慶幸自己又變成了人，但是，現在他和大雁們已經聽不懂對方的話了，而且就要和心愛的夥伴們分別了……

想到這些，尼爾斯傷心地坐在了沙灘上，捂著臉哭了起來。忽然，他聽到了大雁扇動翅膀的聲音。

他睜開眼睛，看到身旁站著一隻大雁。

“阿卡！”他高興地跳起來，把阿卡緊緊摟在懷裡，別的大雁也都圍了上來，大聲叫著，像是在為他祝賀呢。