LC－MS是有機合成中重要的分析工具，解析LC－MS譜圖也是一項基本技能。
LCMS基本原理和特性
1）LCMS的特性：是HPLC和MS的結合，有兩者的功能，又沒有兩者精確。
2）流動相方法：常見0-30，0-60，10-80，30-90四種方法，0，10，30都是指乙腈的含量，乙腈含量越大，流動相極性越小，出峰越靠前。
3）正離子源適用於鹼性化合物：含氮化合物更容易粘附氫正離子，在正離子源中容易出分子離子峰。負離子源適合酸性化合物：酸性化合物更容易轟擊掉氫正離子，如酸，酚類化合物。
看LCMS步驟
1）先看MS部分，看有沒有所要離子峰，並且要看清楚該化合物是否有MS訊號，是否掩蓋周圍的峰。
2）再看HPLC部分，看含量有多少，並且要看清楚該化合物是否有強的HPLC訊號，是否掩蓋周圍的峰。
3）兩者結合起來看，推測反應進行的程度和反應產生的雜質。
常見加合離子峰
1）正離子模式：
[M+Na]+ = [M+23]+加鈉離子；
[M+K]+ = [M+39]+加鉀離子；
[M+NH4]+ = [M+18]+加銨離子；
[M+H+H2O]+ = [M+19]+加水；
[M+X]+這裡X是指溶劑緩衝液中的陽離子；如加硝酸根：[M+NO2]+ = [M+46]+
[M+H+Solvent]+溶劑加合峰，如[M+H+CH3CN]+= [M+42]+ 是CH3CN加合離子，[M+H+CH3OH]+ = [M+33]+是CH3OH加合離子；
2）負離子模式
[M-H]- = [M-1]-減氫負離子
[M+35Cl]- = [M+35]-加氯負離子
[M+37Cl]- = [M+37]-加氯同位素負離子
[M+HCOO]- = [M+45]-加甲酸根負離子
[M+CH3COO]- = [M+59]-加乙酸根負離子
[M+CF3COO]- = [M+113]-加三氟乙酸根負離子
減峰
M-56(脫叔丁基）和M-100（脫Boc），M-16（脫NH3)和M-17（脫水）以及M+2/2（比較常見），其他少見。
常見的離子片段
有機化合物常見元素同位素及其丰度
1H(100%)，2H(0.016%)；10B(19.8%)，11B(80.2%)；12C(100%)，13C(1.08%)；16O(100%)，17O(0.04%)，
LC－MS是有機合成中重要的分析工具，解析LC－MS譜圖也是一項基本技能。
LCMS基本原理和特性
1）LCMS的特性：是HPLC和MS的結合，有兩者的功能，又沒有兩者精確。
2）流動相方法：常見0-30，0-60，10-80，30-90四種方法，0，10，30都是指乙腈的含量，乙腈含量越大，流動相極性越小，出峰越靠前。
3）正離子源適用於鹼性化合物：含氮化合物更容易粘附氫正離子，在正離子源中容易出分子離子峰。負離子源適合酸性化合物：酸性化合物更容易轟擊掉氫正離子，如酸，酚類化合物。
看LCMS步驟
1）先看MS部分，看有沒有所要離子峰，並且要看清楚該化合物是否有MS訊號，是否掩蓋周圍的峰。
2）再看HPLC部分，看含量有多少，並且要看清楚該化合物是否有強的HPLC訊號，是否掩蓋周圍的峰。
3）兩者結合起來看，推測反應進行的程度和反應產生的雜質。
常見加合離子峰
1）正離子模式：
[M+Na]+ = [M+23]+加鈉離子；
[M+K]+ = [M+39]+加鉀離子；
[M+NH4]+ = [M+18]+加銨離子；
[M+H+H2O]+ = [M+19]+加水；
[M+X]+這裡X是指溶劑緩衝液中的陽離子；如加硝酸根：[M+NO2]+ = [M+46]+
[M+H+Solvent]+溶劑加合峰，如[M+H+CH3CN]+= [M+42]+ 是CH3CN加合離子，[M+H+CH3OH]+ = [M+33]+是CH3OH加合離子；
2）負離子模式
[M-H]- = [M-1]-減氫負離子
[M+35Cl]- = [M+35]-加氯負離子
[M+37Cl]- = [M+37]-加氯同位素負離子
[M+HCOO]- = [M+45]-加甲酸根負離子
[M+CH3COO]- = [M+59]-加乙酸根負離子
[M+CF3COO]- = [M+113]-加三氟乙酸根負離子
減峰
M-56(脫叔丁基）和M-100（脫Boc），M-16（脫NH3)和M-17（脫水）以及M+2/2（比較常見），其他少見。
常見的離子片段
有機化合物常見元素同位素及其丰度
1H(100%)，2H(0.016%)；10B(19.8%)，11B(80.2%)；12C(100%)，13C(1.08%)；16O(100%)，17O(0.04%)，