胎兒剛出生時，胃腸道是處於無菌狀態，隨著第一聲啼哭，第一口乳汁，周遭環境中的細菌就會進駐並定植入我們的腸道。

小兒成長的不同時期，腸道中的菌群結構也會因飲食，生活環境，特定疾病，用藥等發生著變化。3歲以後，腸道菌群即可達到穩定的水平。

理論上似乎所有的細菌都可以在腸道內定居，實際卻並非如此，人體腸道內絕大多數的細菌，幾乎佔到99%，是不需要氧氣的。大腸腸道內部環境恰恰符合它們的要求。

經過口腔，胃酸重重淘汰，順利進入腸道內定植的細菌它們的生存繁殖必須也得有水和食物。每天進入消化道的豐富食物，被轉化為人體可吸收的葡萄糖，氨基酸，脂肪酸等，早在胃和小腸就被吸收差不多了。

不能被吸收利用的食物殘渣就成了這些定植菌的良好食物來源。因此，細菌的種屬，分佈和領地絕對和你的飲食行為習慣有關。吃健康的食物，自然會養育很多好的細菌，反過來這些細菌會合成人體所需要的各種維生素，雙方互利互惠。不節制，不健康的飲食，油膩，甜食，吸菸喝酒，都會導致壞菌加速繁殖，俗話說，窮山惡水出刁民，腸道的慢性炎症，情緒不穩定等都與這些壞菌惡劣行為，產生的內毒素破壞腸道內部環境有關。

因此，不要小瞧我們腸道定植菌的建立和維護，這個小小的王國和我們的健康息息相關。

儘管人體還未出生的時候就已經暴露在微生物中，但胃腸道的定植大都是在出生時開始的。僅在幾天之內，在新生兒體內建立的微生物群主要是乳酸桿菌和雙歧桿菌 一年後，菌群開始慢慢趨向穩定，並在三歲左右與成年人類似。

隨著年齡的增長，藥物、飲食、環境和壓力都能改變微生物的丰度和多樣性。比如：超衛生的生活方式、壓力、毒素、酒精、飲食、藥物、維生素 D 的缺乏都會引起我們的腸道菌群的失調。

當嬰兒出生時，經過母親的產道，母親的產道是酸性的，這裡的細菌有一半以上都是 乳桿菌。所以，現代醫學主張儘可能不要剖腹產。在國外，剖腹產的嬰兒，醫生會從母親產道取些微生物，塗抹在嬰兒身上。同時，嬰兒在母乳餵養時，也會透過母親的乳頭和乳汁攝入微生物，這些微生物就會定植在寶寶的口腔和腸道。科學研究證明，正常情況下，雙歧桿菌是第一個居住在寶寶腸道的微生物。慢慢地，寶寶和外界接觸越來越多，進入體內的微生物種類也越來越多，吃的種類多，會讓體內的不同微生物增長。我們老話說：“不乾不淨，吃了沒病”，是有科學依據的。嬰兒為什麼老吃手，吃微生物啊！國外的幼兒園，鼓勵孩子玩泥，玩土，玩沙子，玩微生物啊！有醫學證據，嬰兒接觸貓狗等寵物，會降低過敏的機率，這應該是和嬰兒多接觸貓狗身上的微生物菌群有很大的關係。

我們常說“一方水土養一方人”，很多在國外定居多年的華人，回到家鄉，依然覺得家鄉的飲食美味，媽媽的菜最香，就是因為我們的腸道菌從小吃慣了。而他們在國外出生的孩子卻截然不同，從小喝牛奶，吃漢堡，腸道菌不同啊！