《使徒行者2：諜影行動》最後的魔方是這麼個意思：

一、兩個在東南亞某國孤兒院生活的小孩子，有著一個共同的愛好就是盤魔方，但幼年深厚的共同生活經歷，並沒有讓兩個孩子可以進一步的繼續共同成長，在一次意外中兩個孩子走散了，一個被恐怖組織帶走撫養成了恐怖分子，另一個卻孤獨地長大成人。正邪自古都是勢均力敵相互對立的，但是看過這部電影后會感到，一切都在於相互轉化，正是因為這段兄弟情才形成了正義感化邪惡，最終還是改邪歸正了，我想這也是極為重要的關鍵點。

二、臥底無間風雲起，生離死別揪人心。臥底，是香港警匪片的靈魂調料。隨著街頭的恐怖襲擊，兩位高階警司先後失聯, 《使徒行者2》從“片片蝶衣輕, 點點猩紅小”渲染開來, 把簡單的一個問題:“誰是黑警”變成了一個懸念重重、多方爭鬥的質變過程。

無論你是黑幫還是臥底，在我這你都是兄弟。在生死危急關頭，都會用身體替對方擋刀槍。看似簡單幼稚的成人童話，卻是香港警匪片永恆的魅力所在。我的兄弟是黑警怎麼辦？當然是和他並肩作戰！

三、亦正亦邪真自在。本以為是黑警的古天樂，最後有妻子死亡女兒被綁的苦衷。本以為英勇就義的張家輝，卻為了矇蔽國際組織，自稱是貪錢的警察；三是角色反轉無常態。如果不是張家輝看到了古天樂後背的疤痕，恐怕“誰是臥底”的遊戲觀眾還要猜很久。懸念的設定，讓兩人之間正反角色顛倒數次，凸顯其張力美學的最大魅力。

四、在整個故事線索推開之前，電影先花了一定的篇幅去展現幼年古天樂與張家輝的感情。這和以往主要以“閃回”出現的方式不同，影片著力拓展兄弟情的歲月積澱。這個悲傷的故事告訴我們，小朋友玩魔方太厲害，是會被抓去當黑警的。魔方就像盜夢空間裡的那個陀螺，是個標誌性的物品，開頭結尾相呼應，就像陰陽太極有衍化的寓義。

不知不覺，使徒行者已經迎來了第二部，而且還是原班人班，只是少了佘詩曼和歡喜哥。雖然使徒行者最先火於電視劇，但電影第一部內容也與之契合度相當高，甚至可以說是無縫連線。

張家輝的角色和第一部無變化，而且還特意在劇情中交代了之前的臥底經歷和童年為什麼會消失，但這裡就與第一部有所出入。別的不說，第一部他父親是警察，而在第二部中他卻從小在國外的孤兒院長大，這算是個很大的出入。

古天樂和吳鎮宇的角色因為在第一部都沒有了，所以他們飾演的都是新的角色，兩個警察，一個是張家輝的發小，一個是張家輝的師傅，三個角色交相呼應，前半段的互動真是好看。當得知警察中有內鬼的時候，古天樂、張家輝、吳鎮宇都有嫌疑，雖然很快就在中段揭曉了身份。

還記得第一部最後階段的關鍵道具嗎？那個魔方。張家輝飾演的臥底很喜歡把玩魔方，也很擅長，在第二部中，就以魔方為起始和結束，貫穿了劇中重要的線索。