首先，根據質能守恆，質量和能量間可以相互轉化，正負電子可以碰撞湮滅，正物質和反物質相遇同樣會湮滅為能量，那原子的數量呢？

其次，宇宙中的恆星時刻不停的在進行核聚變反應，最基礎的核聚變是將兩個氫原子聚變成一個氦原子，原子數量有沒有變化呢？

第三，除了聚變反應還有裂變反應，一個大的原子核裂變為幾個小的原子核，同樣，原子的數量有沒有變化？

第四，恆星衰變後形成黑洞，中子星，原子自身都被解構了，原子數量呢？

第五，回到宇宙誕生的那一刻，一切源於奇點的大爆炸，那時候都還沒有原子呢

綜上所述，原子數量並不是不變的

回答這個問題，要知道物質產生、轉化的方向和方法。

物質的來源於宇宙中的基本粒子，目前人類已經發現的基本粒子有62種以上，如夸克、輕子、中微子，其中希格斯玻色子被科學家稱為"上帝粒子"，而且，隨著大型粒子對撞機對粒子不斷地加速，還會發現新型粒子，這些粒子是宇宙中的物質的起源，在宇宙中以暗能量、資訊、暗物質形式存在於宇宙中，在宇宙射線、高溫、強引力的作用下，就可以形成新物質，其中，核聚變是一種途徑，宇宙中的黑洞是新物質形成的重要場所，宇宙中的星體包括衰老的恆星都會以能量的形式進入黑洞，在黑洞的另一個出口形成新物質，新物質存在於平行宇宙中。

愛因斯坦的質能方程所揭示就是這種現象。人類能夠實現原子核的聚變，創造了新物質。也能夠實現原子核的裂變。這些，充分說明，物質的最終去向是以能量(各種粒子)形式存在，回到起始狀態仍然是實體的物質。

宇宙中的能量，不可能無緣無故的產生，也不可能無緣無故的消失。宇宙中所含有的總能量是一個定值，最終形成的物質也是一個總量。

如果有原子消失或產生，那消失後變成了什麼？除了基本粒子，不可能"無影無蹤"，宇宙在膨脹，說明暗能量和暗物質在增加，"消失"的原子並未消失。當宇宙中的暗物質和暗能量增加到一定的程度，就會有新的星體產生。宇宙就是一個能量和物質的迴圈體。反過來，宇宙中的物質也不是總是在增加的，當物質量增加到一定的程度時，物質也會"消失"。萬物有始有終，就是最長壽的恆星也有"壽終正寢"的時候，最長壽的生物烏龜，也要變化為粒子進入宇宙中，參與宇宙中的物質和能量的迴圈。

如果只有產生，沒有消亡，宇宙不復存在，如果只有消亡，沒有產生，宇宙也不復存在，唯有物質和能量的反覆迴圈，宇宙才能存在。物質不滅，能量守恆。原子不可能無緣無故的產生，也不可能無緣無故的消失，只是人類的科技發展，還不能實現質能的快速發生。總有一天，當人類揭開了光和光速的謎團時，原子的產生和轉化就是一個普通的物理問題了。